Alu家族在4种旧世界猴基因组中的特征

论文摘要

为了揭示转座子对旧世界猴基因组多样性和进化的影响,基于Repbase数据库和RepeatMasker比较了4种旧世界猴——东非狒狒Papio anubis、猕猴Macaca mulatta、绿猴Chlorocebus sabaeus和长鼻猴Nasalis larvatus基因组中转座子的特征,重点关注Alu家族的组成、插入/缺失多态性Alu位点和物种特有Alu插入。结果显示,4个基因组中短散在重复序列拷贝数最丰富,平均分歧率最小,其中灵长目Primates特有的Alu逆转座子的拷贝数超过了100万个(长鼻猴除外)。4个基因组中转座子的基本组成和分布与它们的进化关系相吻合,东非狒狒和猕猴的转座子特征相似,二者与绿猴、长鼻猴有较大差异。通过基因组的两两比较,鉴定了大量在4个基因组间具有插入/缺失多态性的Alu位点,以及7 882个各物种特有的Alu位点,95%以上的物种特有位点都属于AluY家族。研究结果揭示了Alu的转座活动对于旧世界猴动物基因组的进化及多样性具有重要影响。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张雪艳,余浩洋,孙天琳,邱实,蔡延森,李静

关键词: 旧世界猴,转座子,家族,多态性位点,物种特有的位点

来源: 四川动物 2019年06期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31530068,31770415)

分类号: Q78

页码: 638-645

总页数: 8

文件大小: 1276K

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标签：旧世界猴论文;  转座子论文;  家族论文;  多态性位点论文;  物种特有的位点论文;