偏肿革裥菌系统发育与Lg-mnp2和Lg-mnp3基因克隆及结构特征

论文摘要

白腐菌偏肿革裥菌Lenzites gibbosa能分泌降解木质素的锰过氧化物酶（MnPs）,为进一步鉴定试验菌株,对菌株L. gibbosa CB1进行了ITS序列（Gen Bank登录号为JF279440）扩增与测序,并进行了基于ITS序列的比对与系统发育分析,结果表明CB1与桦革裥菌L. betulina和栓菌属Trametes等相关白腐菌的亲缘关系较近而聚类在一起,并与24个同种其他菌株的ITS序列覆盖度在85%～97%期间内的相似性都为99%,说明该菌株为偏肿革裥菌。为了获得该菌株多个编码MnP家族的基因,从而为研究MnP基因的表达调控奠定序列结构的基础,根据已知白腐菌MnPs基因保守区和已经扩增出的基因片段设计引物,以L. gibbosa CB1的基因组DNA和总RNA为模板,采用PCR、RT-PCR、RACE及染色体步移等方法,克隆到该菌株编码MnP2和MnP3的全长c DNA和DNA基因（Gen Bank登录号分别为JQ388597、JN571114; JQ411249、JN571116）,分别命名为Lg-mnp2和Lg-mnp3。2个基因DNA全长分别为2 869、3 992 bp,都含有6个外显子和5个内含子;其启动子区域都含有TATA-Box、CAAT-Box、AP2、MRE等顺式作用元件,Lg-mnp2还含有AP1,Lg-mnp3还含有HSE;其c DNA基因分别含有50、52 bp的5’UTR,150、249 bp的3’UTR和1098、1 101 bp的完整开放阅读框ORF,分别编码了365、366个氨基酸的蛋白质多肽前体（Gen Bank登录号分别为AFC37493、AFC37494）,成熟的Lg-mnp2蛋白含有339个氨基酸,比Lg-MnP1蛋白（Gen Bank登录号为ACO92620）多1个氨基酸;成熟的Lg-mnp3蛋白含有340个氨基酸,比Lg-MnP2蛋白多1个氨基酸。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 池玉杰,闫洪波,吴书景

关键词: 偏肿革裥菌,系统发育,锰过氧化物酶,基因克隆,序列分析

来源: 东北林业大学学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 东北林业大学,滨州市生物技术研究院,广西斯道拉恩索林业有限公司

基金: 中央高校基本科研业务费科技平台持续发展专项资金资助(2572018CP05),2018外国文教专家聘请计划高校重点项目(T2018013)

分类号: Q78;X172

DOI: 10.13759/j.cnki.dlxb.2019.02.014

页码: 64-69+87

总页数: 7

文件大小: 2479K

下载量: 37

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标签：偏肿革裥菌论文;  系统发育论文;  锰过氧化物酶论文;  基因克隆论文;  序列分析论文;