拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析

拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析

论文摘要

为研究拟南芥子叶与真叶的发育过程,本研究以模式植物拟南芥为研究材料,通过二代测序、富集分析等生物信息学的方法探索子叶与真叶基因表达的不同。在拟南芥真叶相较于子叶的差异基因分析中,共得到了673个差异基因,其中上调的基因有570个,下调的基因有103个。进一步富集分析表明,拟南芥的真叶与子叶相比,真叶在光合作用以及细胞结构方面有大量差异基因富集,子叶则在糖原代谢以及一些次级代谢通路有大量差异基因富集。本研究结果为研究子叶特有的代谢通路提供了一定的理论基础。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 测序数据
  •   1.2 序列比对
  •   1.3 差异基因
  •   1.4 GO富集分析
  •   1.5 KEGG富集分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 植物材料与数据准备
  •   3.2 分析方法
  •     3.2.1 测序数据质量控制
  •     3.2.2 从EnsemblPlants数据库中下载拟南芥的参考基因组以及注释信息
  •     3.2.3 分析流程
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈健,侯昕

    关键词: 拟南芥,生物信息

    来源: 分子植物育种 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 武汉大学生命科学学院杂交水稻国家重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31570238)资助

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.003894

    页码: 3894-3901

    总页数: 8

    文件大小: 315K

    下载量: 73

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