基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展

基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展

论文摘要

基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象。高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformationcapture, Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识。研究表明,哺乳动物基因组三维层级结构单元由大到小依次为染色体疆域(chromosome territory, CT)、染色质区室(chromatin compartment A/B)、拓扑关联结构域(topological associated domain, TAD)和染色质环(chromatin loop),这些层级结构单元在基因转录和表达调控过程中发挥着重要作用。本文基于Hi-C技术从染色质的三维层级结构划分、构象单元作用以及三维基因组在发育、疾病等方面的应用进行阐述,旨在为更深入地了解哺乳动物三维基因组学研究提供参考。

论文目录

  • 1 哺乳动物三维基因组的结构单元
  •   1.1 染色体疆域
  •   1.2 染色体区室
  •   1.3 拓扑关联结构域
  •   1.4 染色质环
  • 2 Hi-C技术在三维基因组学中的应用
  •   2.1 辅助基因组组装
  •   2.2 构建全基因组单倍型
  •   2.3 基因的表达调控
  •   2.4 机体与细胞发育
  •   2.5 在疾病研究中的应用
  • 3 结语与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宁椿游,何梦楠,唐茜子,朱庆,李明洲,李地艳

    关键词: 三维基因组学,染色质空间构象,技术,基因表达调控

    来源: 遗传 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 四川农业大学动物科技学院动物遗传育种研究所

    基金: 国家重点研发计划项目(编号:2018YFD0500403),国家自然科学基金项目(编号:31772576)资助~~

    分类号: Q953

    DOI: 10.16288/j.yczz.18-317

    页码: 215-233

    总页数: 19

    文件大小: 1080K

    下载量: 685

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