酰基氨肽酶的改造、实时调控及其治疗阿尔茨海默症的研究

论文摘要

随着近年来科技的发展,对于极端环境来源的微生物的研究得到广泛关注。其中在快速发展的酶学领域中,嗜热微生物来源的酶不仅在高温环境下具有良好的稳定性,而且具有令人惊奇的潜在催化能力,此类特性为探索新的生物催化剂的研发与应用提供了新选择。源自嗜热古菌的酰基氨肽酶具有较高的研究价值,已有报道其在合成应用中展现出良好的非专一性催化合成C-C键的能力,且在清除细胞毒性蛋白质中起着关键作用。有鉴于此,我们利用本实验室自主克隆表达的一系列酰基氨肽酶,进行了以下三方面研究:（1）考察酰基氨肽酶的改造对结构功能的影响并筛选性能优良的突变体,研究酶的结构特性,提高非专一性催化Aldol加成反应的产率及催化效率;（2）设计和构建近红外响应型嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体体系,探究该体系在实时调控催化Aldol加成反应中的应用;（3）探究嗜热酰基氨肽酶在阿尔茨海默症治疗方面的应用,提出酶与靶向单链抗体联用的治疗策略,最终构建靶向嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体,实现其在阿尔茨海默症治疗及预防方面的应用。首先我们选择了本实验室已经成功表达的具有不同最适催化温度的酰基氨肽酶（中温酰基氨肽酶BSU32230、嗜热酰基氨肽酶ST0779、超嗜热酰基氨肽酶APE1547）作为研究对象,通过同源比对及结构模拟结果分析,推测酰基氨肽酶的桥接结构元件对酶结构与功能所起的作用,但目前针对该类酶的结构元件的相关报道较少。桥接结构元件是连接两个结构域的枢纽结构,由两个结构元件组成,包括直接连接两个结构域的linker区和由N端伸向C端催化结构域的N-末端α螺旋。本文通过在linker区中插入或敲除氨基酸来改造该区域,重点研究桥接结构的linker区,结果显示linker区直接影响酶的稳定性和催化性能。说明桥接结构元件对酶催化性能影响较大,其对酶结构的稳定性也起着至关重要的作用。本文通过对桥接结构理性改造设计,成功筛选出具有良好稳定性、更佳催化能力的突变体ST-4A,提高了催化Aldol反应的产率,有利于化学合成领域的应用。另一方面,本文选择嗜热酰基氨肽酶APE1547及ST0779作为研究对象,来构建实时调控、高效率、高特异性、高反应可控性的低能耗催化系统。通过构建嗜热酰基氨肽酶偶联金纳米材料复合体,利用近红外光激发纳米金的光热效应,实现局部快速递能以激活酶转化至活性状态并加热反应体系,最终应用于非专一性催化Aldol反应。其中该体系实现酶实时调控催化,即通过近红外光照射作为反应的开关,快速开启和终止酶催化反应,实现反应实时可控。该体系能有效提高酶非专一性催化Aldol有机反应催化速率,催化速率提高8倍。构建的复合体具有较好的可重复利用性和高稳定性,本文成功构建了实时调控固定化酶的催化体系。此外,由于其在清除细胞毒性蛋白质中起着关键作用,酰基氨肽酶具有较高的生物医学研究价值,已有报道人源酰基氨肽酶可作为潜在的Aβ降解酶,有效清除体内毒性Aβ的能力,在治疗阿尔茨海默症中具有潜在应用价值。目前人源酰基氨肽酶纯化后稳定性低,后续应用研究难度较大,阻碍其进一步用于药物的研发。因此,基于酰基氨肽酶潜在的应用价值,有望通过该家族同功能属性的外源酰基氨肽酶进行深入研究及新药研发。在本研究中,我们尝试利用来自于本实验室的嗜热酰基氨肽酶ST0779,检测发现其能有效降解Aβ多肽,降低Aβ介导的相关毒性。基于此,进一步提出嗜热酰氨肽酶ST0779和单链抗体12B4联合给药治疗策略,发现能更好的降解Aβ单体、解聚毒性寡聚体并抑制Aβ介导的相关毒性,具有良好的治疗效果。最终构建了靶向酰氨基肽酶纳米材料复合体,并辅以近红外光实时调控以加强治疗效果,实现在阿尔茨海默症线虫模型中降解Aβ并抑制Aβ介导的相关毒性,延缓线虫瘫痪率,获得一定的治疗效果。此项工作对酰基氨肽酶进行了系统深入的研究,揭示了桥接结构元件与催化机理之间的关系,并筛选出稳定性、催化性能更佳的突变体,为酰基氨肽酶的突变改造开创了新的方向,展现出酰基氨肽酶催化有机合成反应的应用潜力;另一方面,构建纳近红外光照射实时调控催化体系,应用于催化Aldol反应,展现酰基氨肽酶在合成应用中的潜在价值。最后,探究嗜热酰基氨肽酶在降解Aβ中的作用,提出嗜热酰氨肽酶ST0779和单链抗体12B4联合给药治疗策略,发现能更好的作用于Aβ并抑制Aβ介导的相关毒性,对阿尔茨海默症的治疗效果良好。通过以上研究,成功构建了靶向酰氨基肽酶纳米材料复合体,辅以近红外光实时调控加强了治疗效果,实现在线虫模型中降解Aβ的应用,延缓线虫的瘫痪情况。为阿尔茨海默病多功能药物研发提供了新策略,揭示了嗜热酰基氨肽酶在阿尔茨海默症方面的应用价值,为嗜热古细菌作为新型药物的应用彰显出巨大潜能。

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第一章前言

1.1 酰基氨肽酶介绍

1.1.1 酰基氨肽酶的结构与功能

1.1.2 嗜热酰基氨肽酶研究进展

1.2 酶的分子改造

1.2.1 酶的分子改造研究进展

1.2.2 水解酶的突变体在有机合成反应中的应用

1.3 酶的非专一性催化在有机合成中的应用

1.3.1 水解酶的非专一性催化在有机合成反应中的应用

1.3.2 酶的非转一性催化Aldol加成反应

1.3.3 影响酶非专一性催化反应的因素

1.4 纳米材料固定化酶催化技术

1.4.1 纳米材料固定化酶研究进展

1.4.2 纳米材料智能调控酶催化性质研究进展

1.5 AΒ降解酶治疗阿尔茨海默病的研究进展

1.5.1 阿尔茨海默病治疗策略

1.5.2 Aβ降解酶

1.5.3 酰基氨肽酶作为Aβ降解酶的研究进展

1.6 本文的研究思路及主要内容

第二章酰基氨肽酶的分子改造

2.1 引言

2.2 仪器与材料

2.2.1 实验仪器

2.2.2 实验材料

2.3 实验方法

2.3.1 引物设计

2.3.2 序列比对与同源建模

2.3.3 PCR体系及产物处理

2.3.4 突变重组质粒的转化及鉴定

2.3.5 突变体蛋白的表达与纯化

2.4 实验结果与讨论

2.4.1 序列比对与同源建模结果

2.4.2 突变体的PCR结果

2.4.3 突变重组质粒提取及鉴定结果

2.4.4 突变重组体诱导表达及纯化

2.5 本章小结

第三章桥接区分子改造对酰基氨肽酶的影响

3.1 引言

3.2 仪器与材料

3.2.1 实验仪器

3.2.2 实验材料

3.3 实验方法

3.3.1 肽酶活力测定

3.3.2 酯酶活力测定

3.3.3 热稳定性测定

3.3.4 荧光光谱检测

3.3.5 酶催化Aldol反应及产物的分离处理

3.3.6 高效液相检测

3.4 实验结果与讨论

3.4.1 改造对催化活性的最适pH影响

3.4.2 改造对酶底物特异性的影响

3.4.3 改造对酶温度依赖的催化活性影响

3.4.4 改造对酶热稳定性的影响

3.4.5 野生型和突变体在不同浓度盐酸胍中的解折叠研究

3.4.6 野生型和突变体的荧光光谱研究

3.4.7 改造对酶非专一性催化Aldol反应的影响

3.4.8 分子改造对酶与底物作用的影响

3.4.9 改造对酶底物结合数的影响

3.5 本章小结

第四章实时调控嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体催化性能研究

4.1 引言

4.2 仪器与材料

4.2.1 实验仪器

4.2.2 实验材料

4.3 实验方法

4.3.1 嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体的构建

4.3.2 酶活检测

4.3.3 实时调控嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体催化Aldol反应

4.4 实验结果与讨论

4.4.1 实时调控嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体催化性能的研究

4.4.2 嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体实时催化Aldol反应

4.4.3 复合体稳定性及可重复利用率检测

4.5 本章小结

第五章嗜热酰基氨肽酶降解AΒ的体外研究及其实时调控体内研究

5.1 引言

5.2 实验仪器与材料

5.2.1 实验仪器

5.2.2 实验材料

5.3 实验方法

5.3.1 Aβ多肽样品处及理寡聚体纤维的制备、检测

5.3.2 ThT荧光检测

5.3.3 氧化应激检测

5.3.4 Aβ细胞毒性及抑制实验

5.3.5 靶向嗜热酰基氨肽酶纳米材料复合体的构建

5.3.6 线虫的培养

5.3.7 线虫给药及线虫瘫痪检测

5.4 结果与讨论

5.4.1 Aβ寡聚体及纤维的制备检测

5.4.2 酰基氨肽酶与靶向Aβ抗体联用降解Aβ体外研究

5.4.3 靶向酰基氨肽酶纳米材料复合体抑制Aβ介导相关毒性研究

5.4.4 靶向酰基氨肽酶纳米材料复合体降解Aβ的线虫体内研究

5.5 本章小结

结论

参考文献

附录

作者简介及科研成果

致谢

文章来源

类型: 博士论文

作者: 刘冬妮

导师: 高仁钧

关键词: 分子改造,酶的非专一性催化,加成反应,阿尔茨海默症

来源: 吉林大学

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学,精神病学

单位: 吉林大学

分类号: R749.16;Q814

总页数: 108

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