基于叶绿体DNA单倍型的蒙古沙冬青遗传多样性格局探究

基于叶绿体DNA单倍型的蒙古沙冬青遗传多样性格局探究

论文摘要

为保护第三纪孑遗种质资源蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus),使用叶绿体非编码片段psbC-trnS对蒙古沙冬青9个野生居群的cpDNA进行测序,分析中国内蒙古阿拉善左旗和鄂尔多斯高原地区范围内,不同居群间的叶绿体非编码区序列差异以及沙冬青的遗传多样性格局。结果表明:排序后的序列总长度为1 493~1 545 bp,共计110个变异位点,根据序列变异位点共确定出12种单倍型,其中H2单倍型分布最广。通过单倍型建树和单倍型网络分析推测出单倍型H2为可能的祖先单倍型。物种水平上单倍型多样性(Hd)指数为0.297 48,核苷酸多样性(π)指数为0.001 66;居群水平上Hd指数介于0~0.813 19之间。总的遗传多样性Ht为0.309 (0.090 3)高于居群间基因多样性Hs为0.293 (0.078 4),基因交流大部分在居群内部。居群间的遗传分化系数NST=0.018小于GST=0.053 (p>0.05,不显著),表明居群不存在明显的谱系地理结构。中性检验结果认为内蒙古西部地区沙冬青居群拒绝中性进化,群体历经扩张或者基因座位受到负选择作用,符合古老孑遗种说法。通过遗传变异分析提出内蒙古特有种沙冬青的保护策略,进一步的保护建议为实施就地保护、迁地杂交等措施。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 序列特征及单倍型分析
  •   1.2 叶绿体DNA单倍型之间的亲缘关系
  •   1.3 遗传多样性格局
  •   1.4 中性检验和失配分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 供试植物
  •   3.2 基因组DNA提取
  •   3.3 用于PCR扩增的叶绿体DNA通用引物的筛选与确定
  •   3.4 数据处理
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 沈奇,潘月云,臧春鑫,赵志平,关潇,张银东

    关键词: 沙冬青,遗传多样性

    来源: 分子植物育种 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 海南大学热带农林学院,中国环境科学研究院

    基金: 生物多样性保护专项(2096001006)资助

    分类号: Q943

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.001378

    页码: 1378-1384

    总页数: 7

    文件大小: 211K

    下载量: 190

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