二氧化硫胁迫下拟南芥miRNA表达谱分析

二氧化硫胁迫下拟南芥miRNA表达谱分析

论文摘要

以拟南芥为材料,利用高通量测序技术并结合生物信息学分析方法,检测二氧化硫(SO2)处理后拟南芥植株的小分子RNA表达谱,筛选SO2胁迫响应microRNAs(miRNAs)分子,研究植物miRNAs对逆境胁迫的应答机制.结果发现,30 mg·m-3SO2处理72 h后,拟南芥地上组织小分子RNA长度分布发生改变,在对照组和SO2组中均有大量特有的小分子RNA序列,说明SO2胁迫可诱导拟南芥小分子RNA的表达改变.SO2胁迫诱导186个保守miRNA和16个新miRNA分子差异表达,其靶基因主要涉及转录调控、信号转导、代谢、刺激响应等生理过程.差异表达的miR160和miR393可通过生长素信号途径调控植株生长发育,参与植物对SO2的胁迫响应.本研究揭示了植物中参与SO2胁迫应答的miRNA种类及作用机制,进一步阐明了miRNAs在植物抗逆应答过程中的作用.

论文目录

  • 1 引言 (Introduction)
  • 2 材料与方法 (Materials and methods)
  •   2.1 植株培养和SO2胁迫处理
  •   2.2 高通量测序及生物信息学分析
  •   2.3 数据处理及分析
  •   2.4 Real-time PCR
  • 3 结果 (Results)
  •   3.1 SO2胁迫下拟南芥小分子RNA表达谱
  •   3.2 SO2胁迫响应的miRNA分子
  •   3.3 SO2胁迫响应miRNA的靶基因预测
  • 4 讨论 (Discussion)
  • 5 结论 (Conclusions)
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李利红,仪慧兰

    关键词: 拟南芥,高通量测序,生物信息学

    来源: 环境科学学报 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 环境科学与资源利用

    单位: 晋中学院化学化工学院,山西大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金(No.31371868),高等学校博士学科点专项科研基金(No.20121401110007),中国博士后科学基金(No.2014M551056)

    分类号: X503.23

    DOI: 10.13671/j.hjkxxb.2019.0088

    页码: 2392-2397

    总页数: 6

    文件大小: 422K

    下载量: 189

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