6株猪圆环病毒2型全基因组克隆和序列分析

6株猪圆环病毒2型全基因组克隆和序列分析

论文摘要

为了研究猪圆环病毒2型(PCV-2)不同毒株间的基因序列,试验采用PCR方法对有断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)典型症状发病猪的脾脏、淋巴结和肺脏等6份病料(TZ1~TZ6)进行分段扩增PCV-2全基因序列,测序后与GenBank中已知序列进行比对,并用DNAStar软件进行同源性分析及系统进化树的构建。结果表明:测序结果经与GenBank中已知PCV-2序列比较鉴定,确认PCR扩增的6个序列均为PCV-2序列,其长度均为1 767 bp。所得序列与国内毒株JX982227、 KX814348序列的同源性相对较高,为97.7%~99.0%;与国外毒株DQ915584、HQ231328、EF394779、AY424405序列的同源性相对要低一些,为95.8%~96.5%。6株毒株间的同源性较高,为99.1%~100%;TZ3和TZ5与JX982227亲缘关系最密切,6株毒株序列与KX814348的亲缘关系也较近,而与AY424405、HQ231328、EF394779、DQ915584的亲缘关系相对较远。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 病料
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 主要仪器
  •   1.4 引物的设计与合成
  •   1.5 基因组DNA的提取
  •   1.6 PCR扩增
  •   1.7 PCR扩增产物的克隆检测
  •   1.8 测序
  •   1.9 同源性分析及系统进化树的构建
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PCR扩增
  •   2.2 PCR扩增产物的克隆检测
  •   2.3 测序
  •   2.4 同源性分析及进化树的构建
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 董亚青,朱爱萍,郭广富,朱文斗,於敏,曹军平

    关键词: 猪圆环病毒,序列分析,克隆,引物,基因,测序

    来源: 黑龙江畜牧兽医 2019年13期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 江苏农牧科技职业学院,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,江苏兴化市新垛兽医站

    基金: 江苏农牧科技职业学院凤凰人才专项基金项目(10434014001)

    分类号: S852.651

    DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.07.0108

    页码: 74-78

    总页数: 5

    文件大小: 943K

    下载量: 87

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