论文摘要
生长素反应因子（Auxin response factors,ARFs）是一类在植物生长发育过程中发挥着重要作用的转录调控因子.为鉴定ARF家族基因、了解成员特征及其在李果实成熟过程中表达模式,基于‘三月李’及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行PsARF家族基因鉴定,并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质质保守结构域以及表达模式进行分析.共鉴定得到17个PsARF家族成员.生物信息学分析结果表明PsARF家族蛋白质长度在600-1 157 aa之间,分子量（Mr）在66.24×103-129.31×103之间,等电点介于5.44-8.31之间,均为位于细胞核的不稳定亲水蛋白质.系统进化树分析表明PsARF家族成员可分为4组. PsARF蛋白质均具有典型的B3和Auxinresp结构域,且多数具有Aux/IAA结构域.保守基序分析表明,PsARF家族蛋白质包含15个保守基序,但非每个蛋白质均含有保守基序. 10个PsARF家族基因在‘三月李’及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达,不同基因表达模式各不相同.其中,PsARF2和PsARF16在‘三月李’和红肉突变体中的表达模式相反;PsARF10在‘三月李’果肉中表达量显著高于红肉突变体果肉中的表达量.本研究表明PsARF家族成员可能在李果实成熟过程中具有不同的功能,结果可为深入研究PsARF家族基因在李果实成熟过程中的功能奠定基础.（图5表2参40）
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 方智振,姜翠翠,周丹蓉,潘少霖,叶新福
关键词: 转录组,家族,生物信息学分析,表达分析
来源: 应用与环境生物学报 2019年06期
年度: 2019
分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑,农业科技
专业: 生物学,园艺
单位: 福建省农业科学院果树研究所,福建省落叶果树工程技术研究中心
基金: 福建省自然科学基金项目（2017J01043）,福建省省属公益类科研院所基本科研专项（2018R1013-1）,国家自然科学基金项目（31801916）,福建省农业科学院青年英才计划项目（YC2015-9）,福建省农业科学院创新团队项目（STIT2017-1-4）资助~~
分类号: Q943.2;S662.3
DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.05020
页码: 1388-1395
总页数: 8
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