药西瓜UDP-糖基转移酶基因的克隆与表达分析

药西瓜UDP-糖基转移酶基因的克隆与表达分析

论文摘要

为明确药西瓜UDP-糖基转移酶催化葫芦素形成葫芦素配糖体的表达规律,以药西瓜品种"WM9"叶片为供试材料,采用RT-PCR技术克隆药西瓜UDP-糖基转移酶基因,并对编码蛋白进行分析。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR),以ACTIN为内参基因,分析获得的2个药西瓜UDP-糖基转移酶基因在不同组织器官中的表达规律。结果表明:克隆得到2个UDP-糖基转移酶基因,分别为1 546 bp和1 559 bp的cDNA全长序列,命名为UDP-E1和UDP-E2。对扩增获得的序列进行生物学信息分析,确定UDP-E1基因的完整开放阅读框(ORF)为1 314 bp,可编码氨基酸437个,理论分子量为49.02 ku,等电点为5.99,属稳定蛋白,Genbank登录号MK576125。UDP-E2基因的ORF为846 bp,可编码氨基酸281个,理论分子量为32.78 ku,等电点为5.23,属不稳定蛋白,Genbank登录号MK576126。这2个基因属于糖基转移酶超家族。UDP-E1和UDP-E2均与香瓜、黄瓜的UDP-糖基转移酶基因序列相似性最高。在各组织器官中,UDP-糖基转移酶均有表达,且在茎中表达水平最低,叶中表达水平最高。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 植物材料
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 引物设计
  •     1.2.2 药西瓜叶片总RNA的提取及cDNA克隆
  •     1.2.3 生物信息学分析工具
  •     1.2.4 药西瓜UDP-糖基转移酶基因在不同组织中的表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 药西瓜UDP-糖基转移酶基因cDNA的克隆
  •   2.2 药西瓜UDP-糖基转移酶基因生物信息学分析结果
  •     2.2.1 药西瓜UDP-糖基转移酶基因蛋白质理化性状预测结果
  •     2.2.2 药西瓜UDP-糖基转移酶基因编码蛋白质同源性及进化树分析
  •   2.3 药西瓜UDP-糖基转移酶基因在不同组织中的表达分析
  • 3 讨 论
  • 4 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈蒙,杨铭慧,刘月,LEE Sanghyeob,刘海峰

    关键词: 药西瓜,葫芦素,糖基转移酶,基因克隆,实时荧光定量

    来源: 中国农业大学学报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 延边大学农学院,世宗大学自然科学学院

    基金: 国家自然科学基金(31260067),国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(31511140284)

    分类号: Q943.2

    页码: 70-77

    总页数: 8

    文件大小: 402K

    下载量: 192

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