6株H9N2亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列测定与分析

6株H9N2亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列测定与分析

论文摘要

为了解分离自厦门市养殖场、活禽交易市场和活禽屠宰场的H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza viruse,AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的6株H9N2亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:6株分离株的HA裂解位点均符合低致病性禽流感病毒特征,HA受体结合位点尤其是234位氨基酸突变为L,表现出人流感病毒受体结合特性;NA存在颈部9个核苷酸缺失的高致病性分子特征;内部基因NS1基因发生P42S突变,M1基因发生N30D、T215A突变,M2基因发生S31N的突变,PB1-F2基因发生N66S突变,提示当前分离株已出现耐药性、致病性增强的变化。8个基因片段均属于欧亚谱系,内部基因与H7N9、H10N8、H10N6、H5N6亚型亲缘关系密切。本研究结果为本地区禽流感生物学特性研究和防控提供科学依据。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 分离毒株
  •   1.2 主要试剂与仪器
  •   1.3 病毒的分离与测序
  •   1.4 遗传进化分析
  • 2 结果
  •   2.1 病毒的鉴定
  •   2.2 HA基因序列分析
  •   2.3 NA基因序列分析
  •   2.4 分离株毒力相关位点的分析
  •   2.5 分离株耐药性相关位点的分析
  •   2.6 分离株基因之间同源性分析
  •   2.7 与分离株同源性最高的毒株
  •   2.8 全基因的遗传进化分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 蔡振鸿,赵冉,陈琼,杨涛,张丹英,陈永锋,何扬州

    关键词: 禽流感病毒,亚型,基因分析,分子遗传进化分析

    来源: 中国动物传染病学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 厦门市动物疫病预防控制中心

    基金: 厦门市科技计划项目(3502Z20174050)

    分类号: S852.65

    页码: 54-71

    总页数: 18

    文件大小: 1535K

    下载量: 156

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