日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析

日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析

论文摘要

花青素还原酶(anthocyanidin reductase, ANR)是原花青素合成途径中的关键酶,同时花青素还原酶对植物花色苷的积累也发挥着重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,以其转录组测序结果为基础,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到日本蛇根草ANR基因完整的cDNA序列,利用生物信息学方法和工具对日本蛇根草ANR基因的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽、二级结构等进行预测和分析。结果表明,该基因cDNA全长为1 020 bp,编码339个氨基酸,预测其蛋白分子量为36.37 kD,等电点为5.92,为亲水蛋白,不含信号肽序列。综上,本研究成功克隆获得日本蛇根草ANR基因并完成其生物信息学分析,研究结果将为解析该基因的功能奠定基础。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 ANR基因编码蛋白质理化性质分析
  •   1.2 日本蛇根草ANR基因编码蛋白质的同源性分析
  •   1.3 日本蛇根草ANR蛋白信号肽预测
  •   1.4 日本蛇根草ANR的亚细胞定位分析
  •   1.5 日本蛇根草ANR氨基酸疏水性/亲水性的预测分析
  •   1.6 日本蛇根草ANR编码蛋白二级结构与三级结构的预测
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料
  •   3.2 主要试剂
  •   3.3 日本蛇根草总RNA的提取及cDNA的合成
  •   3.4 PCR反应程序
  •   3.5 ANR目的基因的克隆
  •   3.6 日本蛇根草花青素还原酶的生物信息学分析
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙威,申欢,陈婷,彭贵,潘蓉蓉,鞠志刚

    关键词: 日本蛇根草,基因克隆,生物信息学分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 贵州师范大学生命科学学院植物生理发育调控重点实验,贵阳中医学院药学院

    基金: 贵州省联合基金项目(黔科合LH字(2016)7211号),贵州师范大学资助博士科研项目(0516006),贵州省重点实验室建设项目(黔科合计Z字(2011)4005),国家自然科学基金项目(31300317),教育部喀斯特山地生物多样性保护与可持续利用创新团队共同资助

    分类号: Q943.2;S567.239

    DOI: 10.13417/j.gab.038.000233

    页码: 233-238

    总页数: 6

    文件大小: 1042K

    下载量: 185

    相关论文文献

    • [1].国产尖叶蛇根草(茜草科)的订正(英文)[J]. 热带亚热带植物学报 2017(06)
    • [2].抗癌药物在日本蛇根草中的检测(英文)[J]. 上海师范大学学报(自然科学版) 2009(01)
    • [3].日本蛇根草的性状及显微鉴别[J]. 中国中药杂志 2009(09)
    • [4].日本蛇根草黄酮醇合成酶基因的克隆及其序列分析[J]. 基因组学与应用生物学 2018(07)
    • [5].日本蛇根草生物群落种间的联结性[J]. 贵州农业科学 2010(12)
    • [6].大苞蛇根草化学成分的研究[J]. 天然产物研究与开发 2009(03)
    • [7].日本蛇根草无色花青素双加氧酶基因的克隆及其序列分析[J]. 基因组学与应用生物学 2018(06)
    • [8].美丽蛇根草的化学成分研究[J]. 中草药 2009(04)
    • [9].日本蛇根草查尔酮合酶基因的克隆及其生物信息学分析[J]. 分子植物育种 2017(04)
    • [10].日本蛇根草查尔酮异构酶基因的克隆及其生物信息学分析[J]. 分子植物育种 2017(05)
    • [11].滇南蛇根草化学成分的研究[J]. 天然产物研究与开发 2011(04)
    • [12].HPLC法测定日本蛇根草不同组织器官中绿原酸的含量[J]. 中国药师 2015(09)
    • [13].《本草纲目拾遗》雪里花的品种考证[J]. 中国中药杂志 2008(13)
    • [14].日本蛇根草OjGT2基因的克隆与序列分析[J]. 分子植物育种 2019(09)
    • [15].日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析[J]. 分子植物育种 2019(02)
    • [16].日本蛇根草Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析[J]. 分子植物育种 2019(18)
    • [17].日本蛇根草Actin基因片段的克隆及其序列分析[J]. 贵州师范大学学报(自然科学版) 2018(06)
    • [18].雪野湖[J]. 时代文学 2019(05)
    • [19].植物自卫的武器[J]. 山西老年 2015(05)
    • [20].美丽蛇根草正丁醇部生物碱成分研究[J]. 热带农业科学 2017(02)
    • [21].长期服用利血平有何危害[J]. 大家健康 2014(07)
    • [22].湖南4种药用植物新记录[J]. 吉首大学学报(自然科学版) 2018(06)
    • [23].蛇根草水培体系中喜树碱、金丝桃苷及其他组分的初步鉴定[J]. 广东农业科学 2013(19)
    • [24].变红蛇根草(茜草科)的二个新异名[J]. 植物研究 2009(01)
    • [25].二蛇消癥汤治疗卵巢囊肿[J]. 河北中医 2011(04)
    • [26].揭开十大危险植物神秘面纱[J]. 奇闻怪事 2010(07)

    标签:;  ;  ;  

    日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢