论文摘要
通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达情况.结果显示:NpPKS2基因全长6 249 bp,编码2 082个氨基酸;生物信息学分析显示该基因编码1种非还原型聚酮合酶,结构域顺序为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,根据聚类分析和结构域分析,推断NpPKS2为苔色酸合成酶;荧光定量分析显示地衣型真菌皮革肾岛衣中的NpPKS2基因用BMG培养基培养时表达量最高.
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 原晓龙,华梅,陈剑,张传光,王毅
关键词: 皮革肾岛衣,非还原型聚酮合酶,生物信息学,基因表达
来源: 福建农林大学学报(自然科学版) 2019年01期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
基金: 国家自然科学基金项目(31860177),云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055),云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-01)
分类号: Q78
DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2019.01.014
页码: 82-87
总页数: 6
文件大小: 655K
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标签:皮革肾岛衣论文; 非还原型聚酮合酶论文; 生物信息学论文; 基因表达论文;