皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定

皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定

论文摘要

通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达情况.结果显示:NpPKS2基因全长6 249 bp,编码2 082个氨基酸;生物信息学分析显示该基因编码1种非还原型聚酮合酶,结构域顺序为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,根据聚类分析和结构域分析,推断NpPKS2为苔色酸合成酶;荧光定量分析显示地衣型真菌皮革肾岛衣中的NpPKS2基因用BMG培养基培养时表达量最高.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 NpPKS2基因全长cDNA的克隆
  •     1.2.2 NpPKS2基因及其蛋白氨基酸的生物信息学分析
  •     1.2.3 NpPKS2基因在不同培养基上的荧光定量表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 NpPKS2基因全长cDNA的获得
  •   2.2 NpPKS2基因及其蛋白氨基酸序列的生物信息学分析
  •   2.3 NpPKS2基因在不同培养基上的实时荧光定量表达分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 原晓龙,华梅,陈剑,张传光,王毅

    关键词: 皮革肾岛衣,非还原型聚酮合酶,生物信息学,基因表达

    来源: 福建农林大学学报(自然科学版) 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31860177),云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055),云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-01)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2019.01.014

    页码: 82-87

    总页数: 6

    文件大小: 655K

    下载量: 44

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