导读:本文包含了变异剪接论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,信息学,合子,生物,胆汁,胆固醇,选择性。
变异剪接论文文献综述
谢玉霜,包永芬,白育庭,单士刚,杨军[1]（2019）在《变异剪接体的结构、功能及其在疾病治疗中的应用》一文中研究指出变异剪接(alternative splicing)是高等真核生物在发育和应激反应中调控基因表达的一种主要机制,能够调控蛋白表达,或产生编码具有不同功能蛋白的pre-mRNAs。剪接体(spliceosome)由五种snRNP(U1、U2、U4、U5和U6)和许多非snRNP蛋白质构成,参与整个剪接过程。变异剪接与诸多疾病有着密切联系,异常的变异剪接会导致疾病的发生,增加疾病的易感性与病变程度,甚至引起癌变。现就剪接体的生物学特征、剪接体与疾病的关系及其在疾病治疗方面的内容进行综述。(本文来源于《生命的化学》期刊2019年04期）
宋旭婷,翟羽飞,张嘉楠,亓美玉,王志鹏[2]（2019）在《绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析》一文中研究指出为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显着高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显着高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2019年01期）
王能里,陆怡,谢新宝,王建设,Wang,NL[3]（2018）在《表现为低GGT进行性肝内胆汁淤积症的ABCB11杂合子检出的罕见/新发同义变异或内含子变异的剪接分析》一文中研究指出【据《Hepatol Res》2018年6月报道】题:表现为低GGT进行性肝内胆汁淤积症的ABCB11杂合子检出的罕见/新发同义变异或内含子变异的剪接分析(作者Wang NL等)进行性家族性肝内胆汁淤积症2型是常染色隐性遗传性疾病。部分表现为低GGT进行肝内胆汁淤积症的患儿在ABCB11检出1个致病突变和1个罕见/新发同义变异或内含子变异。该研究纳入2009年10月至2016年6月间,检出ABCB11罕见/新发同(本文来源于《临床肝胆病杂志》期刊2018年07期）
庞亚娜,赵晋枫,董元坤,张策[4]（2018）在《受胆固醇调节的变异剪接体及其意义》一文中研究指出目的:检测人肝癌细胞中LDLR的变异剪接体LDLR-?Exon4、LDLR-?Exon12,HMGCS1的变异剪接体HMGCS1-?Exon2和HMGCR的变异剪接体HMGCR-Exon?13是否受胆固醇的调节。方法:建立高胆固醇模型组、低胆固醇模型组及正常组,提取不同模型组的RNA并进行反转录,采用Realtime PCR(RT-PCR)技术检测LDLR-?Exon4,LDLR-?Exon12,HMGCS1-?Exon2和HMGCR-Exon?13的mRNA的表达。结果:在高胆固醇模型组中,与正常组相比,LDLR-?Exon4、LDLR-?Exon12、HMGCS1-?Exon2及HMGCR-Exon?13的mRNA的表达量与各基因全长相比均明显升高(P<0.05);而在低胆固醇模型组中,与正常组相比,上述的变异剪接体mRNA的表达量与各基因全长相比均明显下降(P<0.05)。结论:LDLR-?Exon4、LDLR-?Exon12、HMGCS1-?Exon2及HMGCR-Exon?13等变异剪接体受胆固醇的调节,并可能参与并调控胆固醇的代谢。(本文来源于《中国医学创新》期刊2018年08期）
邹永新,龚瑶琴[5]（2017）在《影响RNA剪接的基因变异》一文中研究指出发现和正确解读疾病相关突变是遗传病分子诊断和临床指导的关键。尽管二代测序技术的应用显着改善了突变检测效率,但解读突变的生物学效应仍然存在挑战。目前对基因检测结果的解读更多地关注突变对蛋白质结构和功能的影响,而忽视了基因变异对RNA剪接的影响。越来越多的证据显示引起RNA剪接异常的基因变异在疾病发生中发挥重要作用。本文对影响RNA剪接的主要突变类型和确认方法进行介绍,以期为准确判断突变的遗传效应提供参考。(本文来源于《遗传》期刊2017年03期）
李利族,韩丽鑫,王金奎,汪亮,刘娣[6]（2015）在《猪PILRA基因克隆及变异剪接体鉴定》一文中研究指出Ⅱ型成对免疫球蛋白样受体(Paired immunoglobulin-like type 2 receptors,PILRs)是免疫球蛋白超家族成员之一,包括α和β两个亚型。PILRα在机体抵抗病原体入侵的免疫反应中发挥着重要作用,但目前尚未见关于猪PILRα的报道。为了分析其在猪抗病育种中的作用,本文克隆了猪PILRα编码基因(PILRA)并鉴定变异剪接体,利用实时荧光定量PCR方法构建其组织表达谱和诱导表达谱。结果表明,成功克隆了猪PILRA基因的3个变异剪接体V1~V3(Gen Bank登录号:KJ143679~81),预测的蛋白质多肽链分别长271 aa、254 aa和283 aa,且都具有免疫球蛋白结构域。各变异剪接体均在脾脏中表达量最高,肝脏、肺脏次之,在心脏、肾脏、胃、肌肉、淋巴、大肠、小肠和膀胱等组织中表达量较低或检测不到。Poly(I:C)能显着诱导变异剪接体V1的表达,但几乎不影响V2、V3的表达。研究结果为进一步揭示PILRA在猪抗病育种中的作用提供了基础。(本文来源于《遗传》期刊2015年09期）
张姣[7]（2015）在《猪SP100基因克隆、亚细胞定位和变异剪接》一文中研究指出核点蛋白SP100(Nuclear dot-associated SP100 protein)是构成早幼粒白血病核小体相关蛋白(Promyelocytic leukaemia nuclear bodies,PML-NBs)的组成性结构,在稳定PML-NBs结构、抗病毒、转录调控和细胞凋亡等生命活动中发挥重要作用。人、鼠上的研究表明,SP100基因存在着复杂的变异剪接方式。目前,尚未见有关猪SP100的研究报告。本研究利用分子生物学技术克隆猪SP100基因cDNA序列及其变异剪接体、分析其亚细胞定位情况,并利用Minigene技术深入分析其变异剪接情况,得到的主要研究结果如下:(1)首次克隆猪SP100基因并获得7个变异剪接体(Gen Bank accession Nos.KC538899、KC540633-5、KF017543-4、KP735962)。V1扩增序列全长1498 bp,含有66 bp 5’非翻译区(Untranslated region,UTR)、1161 bp CDS区和271 bp 3’-UTR,预期编码386 aa。V2、3、5-7是V1发生外显子跳跃形成的,V4是V1发生外显子重复形成的;在相应的多肽链上,V3、4、6和7发生了内部缺失,V2和5则发生移码突变,导致翻译提前终止。V2-7多肽链长度依次为66、336、442、144、272、308 aa。(2)亚细胞定位分析表明,V1、V3、V4、V6和V7都定位在细胞核内,V2和V5均匀地分布在整个细胞内,表明移码突变导致V2和V5的核定位序列(Nuclear localization sequence,NLS)丢失;对变异剪接体V1的截短突变体进行亚细胞定位分析,发现V1(221-386aa)、V1(301-386 aa)定位于细胞核中,V1(1-138 aa)、V1(344-386 aa)在细胞核和细胞质中都有;结合V1、V3、V4、V6和V7的序列组成情况,我们确定NLS位于V1的301-343 aa处;在生物信息学分析的基础上,对334位碱性氨酸(精氨酸)进行定点突变,确定了改变氨基酸的极性对V1亚细胞定位的影响,发现当变为中性氨基酸(色氨酸)时,V1仍定位于细胞核内,当变为酸性氨基酸(谷氨酸)时,则位于细胞质内。(3)序列分析发现,外显子2、8和9含有变异剪接位点,为可变剪接外显子,针对这一区域构建了Minigene载体;通过Minigene分析,在该区域内寻找到3种新的变异剪接方式(NV1-3);为了对Minigene的分析结果进行体内验证,设计了特异扩增NV2的引物,利用RT-PCR方法对内源转录的SP100基因进行扩增,成功获得了以NV2方式剪接的新变异剪接体(命名为V8),证明了Minigene技术可以用于分析基因在体内的变异剪接情况。(4)变异剪接体V8是V1发生外显子3-8跳跃形成的,扩增片段长822 bp,含有66 bp5’UTR、198 bp CDS区和558 bp 3’-UTR。外显子3-8缺失导致终止密码子提前出现,预期编码65 aa的多肽链。该序列已经提交到Gen Bank(accession No.KP939097)。(本文来源于《东北农业大学》期刊2015-06-01）
王秋实[8]（2014）在《猪PILRs变异剪接体的克隆和功能分析》一文中研究指出疾病是危害畜牧生产的大敌,传统的防疫治病措施不仅成本昂贵,还会引发药物残留等问题,对畜禽产品的食用安全带来巨大威胁。从长远角度来看,用遗传学的方法开展抗病育种,从本质上提高畜禽对病原微生物的抗性,才是解决问题的根本途径。抗病育种的关键是揭示疾病发生的分子机制,确定主效基因和分子标记。本课题组利用Solexa高通量测序技术在猪呼吸道上皮细胞内筛选抗病毒候选基因时,发现有一个tag的表达量受至Poly(I:C)的显着调控。基因组比对分析表明,这个tag对应于猪Ⅱ型成对免疫球蛋白样受体(paired immunoglobulin-like type2receptor,PILRs)基因。进一步分析发现,该基因在猪上尚未得到实验克隆。因此,本研究以PILRs为候选基因,利用分子生物学方法对其进行克隆、组织表达和诱导表达研究,并利用双荧光素酶报告系统研究变异剪接对PILRB基因表达的影响,为揭示PILRs在免疫应答过程中的功能和表达调控机制奠定基础。主要研究结果如下：(1)首次克隆了猪PILRA基因的3个变异剪接体(GenBank accession No.KJ143679、 KJ143680.KJ143681),开放阅读框长度依次为816、765和852bp,分别编码271、254和283个氨基酸残基的多肽链。(2)RT-qPCR分析表明,PILRA的3个变异剪接体和PILRB的4个变异剪接体在心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、胃、肌肉、淋巴、大肠、小肠和膀胱等11种组织中均有不同程度的表达,且二者表达规律大致相同：在脾脏中表达量最高,肝脏、肺和淋巴其次,在肌肉中表达量最低。(3)在Poly(I:C)处理的PK15细胞内,PILRA基因的表达量降低、PILRB基因表达量增加,并且二者的表达与Poly(I:C)呈现出时间-剂量依赖效应。(4)克隆了猪PILRB基因3个变异剪接体的3’UTR,分析了3'UTR区的变异剪接对PILRB转录表达的影响,发现3'UTR区的片段缺失影响着PILRB基因的转录,并且缺失片段越大,转录量越低。(本文来源于《东北农业大学》期刊2014-06-01）
丁薇[9]（2012）在《LOC66273变异剪接体2对3T3-L1前脂肪细胞成脂分化和增殖凋亡的影响》一文中研究指出第一部分L1-2基因生物信息学分析及细胞定位[目的]初步了解LI-2基因及蛋白的结构、功能和亚细胞定位,研究LI-2基因及蛋白在小鼠各组织分布情况,为后续研究提供基础。[方法]运用生物信息学方法分析LI-2基因及蛋白的结构和功能,在荧光显微镜下观察其亚细胞定位。采用半定量RT-PCR检测小鼠各组织LI-2基因mRNA水平,Western-blot免疫印迹法检测小鼠各组织LI-2蛋白表达水平。CREB荧光素酶反式报告检测系统的高通量筛选技术筛查与CREB相互作用的调控基因。[结果](1)小鼠LI-2基因位于染色体7E2上,可译框架为789bp,编码122个氨基酸,预测分子量为13.2kDa,等电点为7.77；系统发育分析表明,LI-2基因在多种物种体内高度保守,但与任何已知基因和蛋白质没有明显同源性。保守域分析表明,LI-2中有一个预测的Mth938结构域(氨基酸残基5-120)；(2)LI-2基因在脂肪、骨骼肌、小肠、肺及肾脏组织均有表达,但在脂肪和骨骼肌组织表达较高；LI-2的亚细胞定位提示,GFP-LI2融合蛋白在细胞质中弥漫分布,并在核周围有一些高度集中点；(3)CREB荧光素酶报告基因检测系统结果提示过表达LI-2增加了CREB的活性,其活性是空白对照组的2.5倍。I结论]LI-2基因在多种物种体内高度保守,提示了它具有重要的功能。LI-2在白色脂肪组织高表达,同时基于定量的CREB荧光素酶反式报告检测系统的高通量功能性筛选平台显示了与CREB转录活性相关的基因中包括LI-2基因。这些信息都提示了LI-2基因可能与成脂分化有关。第二部分LI-2在MDI诱导3T3-L1细胞成脂分化过程中的表达变化[目的]研究MDI叁联诱导3T3-L1前脂肪细胞成脂分化过程中LI-2变化情况。[方法]本部分实验通过油红染色、Western-Bloting印迹、半定量RT-PCR等实验技术观察研究MDI叁联诱导3T3-L1前脂肪细胞成脂0、2、4、8天细胞形态、脂滴沉积和LI-2基因mRNA及蛋白水平变化情况。[结果](1)MDI诱导3T3-L1前脂肪细胞2d后,细胞逐渐变圆变亮,梭形前脂肪细胞逐渐变为椭圆形,胞浆内可见油红0染成亮红色的少量脂滴,诱导分化6d,胞核四周出现较大脂滴；诱导分化后8d,可见90%以上细胞具有成熟脂肪细胞表型。(2)半定量RT-PCR结果显示MDI叁联诱导4d后,3T3-L1前脂肪细胞的LI-2mRNA水平显着升高(P<0.05),并在分化过程中持续增长；Western blot结果显示3T3-L1前脂肪细胞内的IL-2蛋白水平随着分化逐渐增多,诱导第4天变化明显,有显着差异(P<0.05)。[结论]用经典的鸡尾酒MDI叁联诱导可以成功的建立3T3-L1前脂肪细胞成脂分化模型,为后续实验奠定基础。随着3T3-L1前脂肪细胞分化,我们发现LI-2基因的mRNA和蛋白水平均较分化早期明显升高,这进一步证实了LI-2与细胞成脂分化相关。第叁部分过表达LI-2对3T3-L1细胞增殖和分化的影响[目的]在细胞过表达LI-2的情况下,研究LI-2对3T3-L1细胞成脂分化及细胞增殖和凋亡的影响。[方法](1)用pcDNA3.1-LI2质粒转染3T3-L1前脂肪细胞,用倒置显微镜分别观察转染质粒pcDNA.3.1-LI2,转染pcDNA.3.1空白载体以及MDI诱导的未转染任何质粒的叁组3T3-L1前脂肪细胞的细胞形态变化,并用油红染色观察细胞脂滴沉积情况；(2)细胞增殖活力检测(MTT法)检测上述叁组细胞连续培养8天增殖情况；(3)用流式细胞仪检测分析LI-2对细胞凋亡的影响；(4)用流式细胞仪对上述叁组细胞进行细胞周期检测；(5)采用实时荧光定量PCR和Western blot免疫印迹法检测过表达LI-2对3T3-L1细胞成脂分化相关基因的mRNA及蛋白表达水平的影响。[结果](1)过表达LI-2的3T3-L1前脂肪细胞在没有MDI叁联诱导下,可见细胞逐渐变圆变亮,梭形成纤维细胞逐渐变为椭圆形,与MDI诱导的3T3-L1前脂肪细胞变化类似,均发生了脂肪分化,仅转染pcDNA.3.1空白载体的3T3-L1前脂肪细胞形态未有明显变化。用油红O细胞染色可见,叁组细胞培养8天后,pcDNA.3.1-LI2转染3T3-L1前脂肪细胞和MDI诱导的3T3-L1前脂肪细胞在低倍镜和高倍镜下观察均可见大片亮红的脂滴,但pcDNA.3.1空白载体转染的3T3-L1前脂肪细胞培养8天后仅见极少数脂滴；(2)用MTT法检测空白对照组、转染pcDNA.3.1-LI2质粒组和转染pcDNA.3.1空白载体组细胞存活率,结果提示转染pcDNA.3.1-LI2质粒组的细胞存活率相对于其他两组在转染后4、6、8天时间点均明显下降(P<0.05)；(3)流式细胞仪在分析细胞周期分布提示转染pcDNA.3.1空白载体的细胞,在用血清处理24小时或36小时后,S时期和G2/M时期的细胞数量大大增长。相反地,在血清处理24小时或36小时后,处于S时期和G2/M时期的L12过表达的3T3-L1细胞的比例几乎没有变化(P<0.05)；(4)流式细胞仪测转染2天和4天叁组细胞凋亡率,结果提示叁组细胞4天细胞凋亡率均较2天增多,但各组间无明显差异；(5)成脂分化的两个关键基因PPARγ和C/EBP α的mRNA水平在pcDNA3.1-LI2转染的3T3-L1前脂肪细胞中高于空白载体对照组,有显着差异(P<0.05,),基因水平也随着培养天数逐渐升高；Western blot检测3T3-L1前脂肪细胞在转染pcDNA3.1-LI-2或pcDNA3.1空白载体后4天和8天的PPARγ、C/EBP α、PREF-1、GADD153、α FABP和FAS的蛋白水平,结果提示,细胞转染后4天和8天,过表达LI-2细胞的促成脂基因PPARγ、 C/EBP α和助于脂肪酸转运、合成的α-FABP、FAS蛋白表达水平明显高于空白载体对照组,而其抑制前脂肪细胞分化的Pref-1和GADD153蛋白表达水平明显低于空白载体对照组。[结论]L1-2在促进促成脂调节因子的表达的同时也会抑制成脂负调节因子的表达,有利于成脂分化的进行。另外L1-2可以抑制前脂肪细胞增殖,有促进前细胞进入成脂分化的作用,但在本部分实验未观察到LI-2对于细胞凋亡的影响,我们将进一步研究沉默LI-2对于细胞凋亡的影响。第四部分沉默LI-2对3T3-L1细胞凋亡和分化的影响[目的]通过沉默LI-2基因来进一步探索LI-2与3T3-Ll前脂肪细胞凋亡和分化的关系及具体机制,从正反两个方面来阐明这一论题。[方法](1)用siRNA干扰片段转染3T3-Ll前脂肪细胞,用倒置显微镜分别观察转染siRNA干扰片段转染组及转染阴性对照non-siRNA质粒组的细胞形态变化,并用油红染色观察细胞脂滴沉积情况；(2)用Hoechst33342试剂细胞染色后在荧光显微镜观察细胞凋亡情况,并用流式细胞仪分析检测细胞凋亡；(3)Ac-DEVD-AMC分析各组细胞在不同时间点caspase-3的活性和用Western blot免疫印迹法检测caspase-3蛋白表达水平；(4)CREB双荧光素酶报告检测系统分析沉默LI-2对CREB活性的影响,同时采用Western blot免疫印迹法检测CREB和p-CREB的蛋白表达水平；(5)采用实时荧光定量PCR和Western blot免疫印迹法检测沉默LI-2对3T3-L1细胞成脂分化相关基因的mRNA及蛋白表达水平的影响。[结果](1)沉默LI-2的两组3T3-L1前脂肪细胞在MDI叁联诱导下,细胞形态未有明显变化,而MDI诱导的阴性对照组的3T3-L1前脂肪细胞逐渐变圆变亮,梭形成纤维细胞逐渐变为椭圆形,发生了脂肪分化。用油红O细胞染色可见,叁组细胞培养8天后,siLI-2-1、siLI-2-2转染的3T3-L1前脂肪细胞仅见极少数脂滴,MDI诱导的阴性对照组细胞在低倍镜和高倍镜下观察均可见大片亮红的脂滴；(2)3T3-L1前脂肪细胞转染siLI-2-1、siLI-2-2或non-siRNA后2天,开始MDI叁联诱导4天后,荧光显微镜可观察到转染siLI-2-1、siLI-2-2细胞胞核皱缩,呈碎片状,边缘化,且有凋亡小体形成,而转染non-siRNA的细胞胞核形态完整；流式细胞仪检测转染2天和4天叁组细胞凋亡率,结果提示,沉默LI-2的两组细胞在MDI叁联诱导下,凋亡率相对于阴性对照组明显升高；(3)上述叁组细胞在MDI叁联诱导4天后,根据释放的AMC荧光强度的大小,测定caspase-3的活性结果提示,沉默LI-2的两组细胞在MDI叁联诱导下,caspase-3的活性相对于阴性对照组明显升高,同时Western blot免疫印迹法检测结果显示caspase的蛋白表达水平也明显高于阴性对照组；(4)CREB荧光素酶反式报告检测系统的检测结果显示转染后,用MDI叁联诱导叁组细胞2天和4天发现,沉默LI-2组的相对荧光素酶活性要明显低于阴性对照组(P<0.05)；western bloting检测各组细胞的CREB和pCREB蛋白表达水平的结果提示,LI-2基因沉默组的细胞pCREB蛋白表达水平要明显低于阴性对照组(P<0.05),但叁组细胞的CREB蛋白表达水平无显着差异；(5)沉默LI-2基因抑制3T3-L1前脂肪细胞细胞PPARγ和C/EBP α基因mRNA和蛋白表达水平,同时也抑制了助于脂肪酸转运、合成的α FABP、FAS蛋白表达,但成脂负调控因子Pref-1和GADD153蛋白表达水平明显高于阴性对照组。[结论] L1-2一方面通过调节某些转录因子的表达促进细胞成脂分化,另一方面通过抑制细胞增殖和凋亡来维持成脂分化的进行。(本文来源于《复旦大学》期刊2012-03-28）
李素雅[10]（2011）在《鸡Lpin1基因的可变剪接体表达特性及基因侧翼区变异的效应研究》一文中研究指出Lpin1基因是一种编码Mg2+依赖性的磷脂酸(PA)磷酸化酶的基因。该基因对动物脂肪的沉积具有重要的影响作用,Lpin1基因的不表达、正常表达、过量表达均能引起脂肪沉积的剧烈变化;另外,该基因序列出现缺失、反转和复制现象时可能会引起较为严重的疾病。Lpin1基因对脂肪沉积的影响在转基因过量表达小鼠和自然人群中的研究结果得到相反的结论,在鸡上的研究尚很少。本研究主要进行了鸡Lpin1基因不同剪接体的鉴定及表达特性研究及其侧翼区变异与固始鸡资源群性状的关联研究。采用跨越鸡Lpin1基因编码序列的引物进行长程PCR扩增和PCR产物的克隆测序,鉴定了鸡Lpin1基因的叁种转录变异体,分别命名为鸡Lpin1-α、Lpin1-β和Lpin1-γ。根据得到的鸡Lpin1基因不同变异体的序列设计其特异性引物,分别采用半定量和TaqMan荧光定量PCR方法检测总Lpin1基因、Lpin1-α基因和Lpin1-β基因的表达情况。结果显示,总Lpin1基因、Lpin1-α基因和Lpin1-β基因在所有组织中均有表达,总Lpin1基因在卵巢中表达量最高,在胰腺中最低;Lpin1-α基因在卵巢中表达量最高,在胰腺中最低;Lpin1-β基因在胸肌和腿肌中表达量最高,在胰腺中表达量最低。采用TaqMan荧光定量PCR进行Lpin1基因及其剪接体在两个鸡种(黑羽鸡和麻羽鸡,麻羽鸡平均体重比黑羽鸡重1kg)不同组织表达情况的比较,结果表明总Lpin1基因和Lpin1-α基因在两个鸡种的卵巢中表达量最高,胰腺中表达量最低;Lpin1-β基因在黑羽鸡和麻羽鸡腿肌和胸肌中表达量最高,胰腺中表达量最低。采用TaqMan荧光定量PCR进行鸡Lpin1基因及其剪接体在丝毛乌骨鸡不同生长时期的表达特性研究,结果表明在肝脏组织中,总Lpin1基因及其剪接体在1日龄表达量最高,并分别与其它几个周龄的表达量达到差异显着水平;在皮肤组织中,总Lpin1基因及其剪接体在1日龄表达量最高,但与其它几个周龄的表达量未达到差异显着水平;在肌肉组织中,总Lpin1基因及其剪接体在8周龄表达量最高,并分别与其在4周龄和16周龄的表达量达到差异显着水平。鸡Lpin1基因及其剪接体在能量限制组与自由采食组爱拔益加肉鸡中的研究结果表明,能量限制显着提高了总Lpin1基因、Lpin1-α基因和Lpin1-β的表达水平,其中总Lpin1基因在能量限制组中的表达量是自由采食组的3.8倍,Lpin1-α基因在能量限制组中的表达量是自由采食组的4.4倍,Lpin1-β在能量限制组中的表达量是自由采食组的4.0倍。以丝毛乌骨鸡、来航鸡、卢氏鸡、洛克鸡、固始鸡、河南斗鸡血样DNA以及固始鸡-安卡鸡F2代资源群血样DNA为研究对象,通过克隆测序与直接测序相结合的方法在Lpin1基因3'非翻译区(Untranslated regions, UTR)共检测到6个SNPs和一个MNLP (Multiple Nucleotide Length Polymorphism);在Lpin1基因5'非翻译区共检测到11个变异位点,包括8个SNPs、1个QNP (Quintupling Nucleotide Polymorphism)、1个MNLP(multiple nucleotide length polymorphisms,MNLPs )和1个插入/缺失。对Lpin1基因3′UTR的C/G突变以及5′UTR的MNLP位点(CAAGAGAATAACCCTTGCTGGA/TCTATTTCATT)变异分别进行基因分型,并与资源群体性状进行关联分析。结果显示,Lpin1基因3′UTR的C/G突变对胸肌纤维直径的影响达到差异极显着水平。Lpin1基因5′UTR的CAAGAGAATAACCCTTGCTGGA/TCTATTTCATT缺失变异对腿肌纤维直径、胸肌密度以及血液中葡萄糖含量的影响都达到差异显着水平。运用Microspector软件对Lpin1基因3′UTR区域miRNA结合位点进行预测,发现Lpin1基因3′UTRC/G位点的变异会引起miRNA结合位点的改变。本研究根据Lpin1基因3′UTR的C/G突变从固始鸡-安卡鸡F2代资源群中挑选不同基因型个体的肌肉和肝脏组织各5个为实验材料,分析Lpin1基因及其不同剪接体在不同基因型的表达情况,结果显示,Lpin1基因及其不同剪接体的表达量在不同基因型间差异不显着,Lpin1-β在不同基因型肌肉中的表达量显著高于其在肝脏中的表达量。本研究通过对鸡Lpin1基因及其不同剪接体表达特性研究,以及鸡Lpin1基因侧翼区多态性研究,为进一步研究鸡Lpin1基因的功能和阐明鸡脂肪沉积的分子机理奠定了基础。(本文来源于《河南农业大学》期刊2011-06-01）
变异剪接论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显着高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显着高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
变异剪接论文参考文献
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