二去氢鸟嘌呤核苷论文-何冰

二去氢鸟嘌呤核苷论文-何冰

导读:本文包含了二去氢鸟嘌呤核苷论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:2’,3’-二脱氧-2’,3’-二去氢鸟嘌呤核苷(D4G),构象稳定性,N-糖苷键稳定性,密度泛函理论

二去氢鸟嘌呤核苷论文文献综述

何冰[1](2007)在《2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷构象和N-糖苷键稳定性的理论研究》一文中研究指出核苷类抗病毒药物是治疗艾滋病、疱疹、肝炎等病毒性疾病的重要药物。2’,3’-二脱氧-2’,3’-二去氢鸟嘌呤核苷(D4G)是一个很有潜力的抗爱滋病毒和肝炎病毒的药物。对D4G分子结构以及在溶液环境中的性质研究是理解D4G分子发挥药物性能的基础。本文对D4G分子的构象在气相,水相以及酸性环境的结构等性质做了理论研究。我们采用密度泛函方法在B3LYP/6-31+G**水平上研究了2’,3’-二脱氧-2’,3’-二去氢鸟嘌呤核苷分子(D4G)的构象。分别研究在气相中的孤立分子和一水合物的异构体的相对稳定性和异构体之间的相互转变过程,分析了水分子的参与对D4G异构体的相对稳定性和几何结构参数以及自然电荷的影响。结果表明,孤立的D4G分子在气相中存在八种稳定构象,其中构象d4g-2是所有构象中最稳定的,气相中D4G主要以d4g-2存在。气相中各构象的相对稳定性为:d4g-2> d4g-1> d4g-5> d4g-3> d4g-6> d4g-4> d4g-8> d4g-7。计算得到的各构象键长和键角数据与实验值比较非常接近。一个水分子的加入对D4G分子的构型参数有所影响,基本不改变D4G分子各构象的稳定性顺序,但构象转变的能垒有所提高。一个水分子的加入对各构象健角和二面角的影响非常小,水分子的存在均使得各原子电荷正值更正,负值更负,同时,也使各构象之间的转变较气相中变得困难。各构象一水合物稳定性顺序为:d4g-2-h2o> d4g-1-h2o> d4g-5-h2o> d4g-3-h2o> d4g-6-h2o> d4g-8-h2o> d4g-4-h2o> d4g-7-h2o。氢键在分子构象中发挥了重要作用。通过计算修饰的核苷化合物由质子化所引起的N-糖苷键的变化有助于理解N-糖苷键的稳定性等基本性质,从而可以帮助我们进一步理解酸催化水解机理的诸多性质。在第叁章中我们对D4G分子N-糖苷键在酸性环境中的稳定性做了理论研究。在D4G分子中,碱基部分有N(3),N(7)以及O(11)原子容易受到质子进攻。我们分别研究了一个质子进攻负电中心和两个质子进攻负电中心的情况。发现,在较低酸度进行单质子化时, N-糖苷键的稳定性顺序为O11H >N3H> N7H。双质子化时各构象苷键以及相关键长、电荷较单质子化时有较大改变。D4G分子在容易发生双质子化的较高酸度下,N-糖苷键的稳定性大大变差,容易在质子化作用下发生N-糖苷键的断裂,进而降解形成糖和鸟嘌呤。叁对负电中心在进行质子化竞争时,N(3)-N(7)将极具优势。(本文来源于《四川大学》期刊2007-04-30)

何冰,薛英,郭勇,鄢国森[2](2007)在《2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷构象稳定性的理论研究》一文中研究指出采用密度泛函方法在B3LYP/6-31+G**水平上研究了2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷分子(D4G)的构象.分别研究在气相中的孤立分子和一水合物异构体的相对稳定性和异构体之间的相互转变过程,分析了水分子的参与对D4G异构体的相对稳定性和几何结构参数以及自然电荷的影响.结果表明,孤立的D4G分子在气相中存在8种稳定构象,其中构象d4g-2是所有构象中最稳定的,气相中D4G主要以d4g-2存在.气相中各构象的相对稳定性为:d4g-2>d4g-1>d4g-5>d4g-3>d4g-6>d4g-4>d4g-8>d4g-7.计算得到的各构象键长和键角数据与实验值接近.一个水分子的加入对D4G分子的构型参数有所影响,基本不改变D4G分子各构象的稳定性顺序,但构象转变的能垒有所提高.氢键在分子构象中发挥了重要作用.(本文来源于《化学学报》期刊2007年06期)

二去氢鸟嘌呤核苷论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

采用密度泛函方法在B3LYP/6-31+G**水平上研究了2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷分子(D4G)的构象.分别研究在气相中的孤立分子和一水合物异构体的相对稳定性和异构体之间的相互转变过程,分析了水分子的参与对D4G异构体的相对稳定性和几何结构参数以及自然电荷的影响.结果表明,孤立的D4G分子在气相中存在8种稳定构象,其中构象d4g-2是所有构象中最稳定的,气相中D4G主要以d4g-2存在.气相中各构象的相对稳定性为:d4g-2>d4g-1>d4g-5>d4g-3>d4g-6>d4g-4>d4g-8>d4g-7.计算得到的各构象键长和键角数据与实验值接近.一个水分子的加入对D4G分子的构型参数有所影响,基本不改变D4G分子各构象的稳定性顺序,但构象转变的能垒有所提高.氢键在分子构象中发挥了重要作用.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

二去氢鸟嘌呤核苷论文参考文献

[1].何冰.2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷构象和N-糖苷键稳定性的理论研究[D].四川大学.2007

[2].何冰,薛英,郭勇,鄢国森.2',3'-二脱氧-2',3'-二去氢鸟嘌呤核苷构象稳定性的理论研究[J].化学学报.2007

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