从头算方法论文_庞伟秀,孙运斌

导读:本文包含了从头算方法论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:溶剂,分子结构,常数,光谱,方法,离子,效应。

从头算方法论文文献综述

庞伟秀,孙运斌[1](2017)在《从头算方法研究H_2S分子的非谐振力场和光谱常数》一文中研究指出本文用密度泛函理论中的B3LYP,B3P86和B3PW91方法和二阶微扰理论MP2结合cc-pVQZ基组计算了H_2S分子的平衡结构以及非谐振力场.将计算的光谱常数与实验结果相比较,并预测了H_2S分子的偶极矩.通过分析计算结果可以得出密度泛函理论的叁个计算方法对应理论结果相差不大,其中MP2方法计算的结果与实验结果符合最好.(本文来源于《阴山学刊(自然科学版)》期刊2017年04期)

杨巧凤,张超,王倩,赵东霞,杨忠志[2](2017)在《应用ABEEMσπ浮动电荷力场和从头算方法研究CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽水溶液中的结构和性质》一文中研究指出通常人体中的化学反应是在水中进行的,氨基酸作为构成蛋白质的基本单位,研究其在水溶液中的各种性质就显得尤为重要。本文对CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽进行研究,先在B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平下对其结构进行优化,再应用ABEEMσπ方法进行局部扫描验证得到相应的局部极小值点,即稳定构象。之后再采用PCM模型对其溶剂化自由能进行计算。选择ABEEMσπ浮动电荷极化力场~([1]),把CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽结构放入水盒子中央进行探究;并在温度298K下,采用NVT系综对CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽结构的水溶液进行动力学模拟,模拟时间1ns。然后使用ABEEMσπ/GB/SA模型计算它们的溶剂化自由能~([2])、非极性和极性部分溶剂化自由能、溶剂可及表面积以及亲水表面积和疏水表面积。计算结果表明,ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场可以准确的计算多肽的溶剂化自由能。可以为蛋白质及其他多肽水溶液的研究提供有利工具。(本文来源于《第十叁届全国量子化学会议论文集——第四分会:生命、药物和材料量子化学》期刊2017-06-08)

庞伟秀,孙运斌[3](2017)在《从头算方法研究SO_3分子的光谱常数》一文中研究指出本文用从头算方法中的二阶多体微扰理论MP2以及密度泛函理论中的B3LYP和B3PW91方法结合cc-p VTZ基组计算了SO_3同位素分子(~(32)S~(16)O_3、~(32)S~(18)O_3、~(34)S~(16)O_3、~(34)S~(18)O_3)的平衡结构以及振动和转动光谱常数.分析同位素取代对四个谐振频率的影响.将计算的光谱常数与实验结果相比较,并预测了SO_3分子的偶极矩.通过分析计算结果可以得出B3PW91方法计算的结果与实验结果符合得最好.(本文来源于《阴山学刊(自然科学版)》期刊2017年03期)

宋艳丽,刘亚军[4](2015)在《旋轨耦合从头算方法研究CH_2BrI光解离机理》一文中研究指出基于CH2Br I光解离的最新实验报道,采用多态完全活化空间二阶微扰理论和完全活化空间态相互作用-旋轨耦合作用(MS-CASPT2/CASSI-SO)方法,计算了CH2Br I在乙腈、2-丁醇和环己烷3种溶剂中,在266nm的光激发下的旋轨耦合态的势能曲线,指认了实验观测到的解离产物I(2P3/2)和I*(2P1/2)的具体解离途径.为了理解不同溶剂对光产物重新结合成CH2Br—I和CH2I—Br的影响,对CH2Br I在溶剂中光异构化过程的反应机理进行了探讨.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2015年11期)

陶海征,韩学才,岳远征,赵修建[5](2015)在《基于从头算方法玻璃的结构模拟与探测》一文中研究指出玻璃关系着国民经济的各个领域,具有不可替代的作用。考虑到组成、结构和性能的紧密关系,为实现玻璃的功能优化,探索决定玻璃性能的基因(结构基团)就显得特别重要。由于能对很小的结构基团进行探测(不像XRD技术,需要至少150~200nm的相千长度;也不像NMR技术,主要是对最近邻配位环境进行探测),拉曼散射技术是研究玻璃微结构的重要工具之一。利用该研究工具可获得玻璃中微结构单元组成和微结构单元间联结方式等近程和中程序信息。但是,在人们基于原子间键合方式和结构认识基础上充分理解玻璃中原子基团的振动属性之前,拉曼谱图的阐释存在很大的唯象性。针对该现状,以玻璃中最简单结构基团为基础,结合群论理论分析,探索各个结构单元的拉曼活性振动模式;基于从头算方法,利用Gaussian03软件,给出了各结构单元的计算拉曼光谱;通过与计算拉曼光谱的比较,对各实测拉曼光谱的谱峰进行了归属和分析;进而提出玻璃的结构模型,深刻理解玻璃性能演化的结构起源。(本文来源于《2015年全国玻璃科学技术年会论文专集》期刊2015-04-11)

王影[6](2015)在《从头算方法和ABEEMσπ模型应用于Li~+/Na~+/K~+/Be~(2+)/Mg~(2+)/Ca~(2+)与甲基取代的碱基及水相互作用的研究》一文中研究指出采用高水平量子化学方法MP2/6-311+G(d,p),研究了Li~+/Na~+/K~+/Be~(2+)/Mg~(2+)/Ca~(2+)与甲基化的核酸碱基(A、G、C、T、U)及水相互作用的体系base-M-(H_2O)_n(M=Li~+/Na~+/K~+/Be~(2+)/Mg~(2+)/Ca~(2+),n=0~2),优化了体系的结构,对稳定结构进行虚频计算,并采用BSSE校正结合能,使用HF/STO-3G进行了电荷布局分析。结果表明,二价金属离子与配体碱基及水的结合能要远比一价的大,距离比一价的小0.3?左右;随着水数目由0增加到2,金属离子到配位原子(N/O)的平均距离越来越大,但整体变化幅度都是较小的;电荷分析表明,金属离子的电荷主要转移到水中。此外,采用相同基组6-311+G(d,p),不同方法(B3LYP、B3PW91、M062X、MP2、ωB97XD)对金属离子-碱基体系进行结构优化和能量计算,发现复合物的稳定性顺序都相近,不同方法下的相同体系,其结构和能量大致相同。而对于一价金属离子,ωB97XD给出了较大的结合能。总的来说,B3PW91可给出与MP2方法下最相近的复合物结构、结合能。应用原子-键电负性均衡浮动电荷可极化分子力场(ABEEMσπ/MM)模型,以从头算方法所得量子化学结果为标准,构建了Na~+/K~+-(H_2O)_4体系的作用势,并确定了Na~+和K~+相关参数。将该参数转移到计算Na~+/K~+的与碱基体系的势能函数中,计算了Na~+/K~+与碱基的电荷分布、结构和结合能,得到了与量子化学计算相一致的结果。对于所有的化合物,ABEEMσπ模型所得的电荷分布,与HF/STO-3G方法所计算的电荷分布的线性相关系数均在0.96以上,说明ABEEMσπ模型所计算的分子的电荷分布可与从头算的结果相比拟。同时,QM与ABEEMσπ/MM优化的结构也趋近一致。将Na~+和K~+的ABEEMσπ参数转移到Na~+/K~+与碱基及水分子相互作用的体系中,也很好地重现了量子化学的结果。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2015-04-01)

杨丽君,刘茜,杨胜勇,文丰玉[7](2012)在《从头算方法研究五元杂环与苯环相互作用》一文中研究指出采用Gaussian03程序用MP2/6-311g(2d,p)方法计算了叁组(9个)五元杂芳环与苯环处于4种构型时相互作用能随二聚体各参数变化的情况,在此基础上用正交实验设计方法探索4种构型下环间相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数的最优值。结果表明,4种构型中,含NH基团的杂环均在与苯环处于T-shaped构型时有最大相互作用能,相互作用能的主要影响因素是环间二面角;含S杂环与苯环相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数最优值与二聚体构型及五元杂环所含N原子位置有关;而含O杂环与苯环相互作用能的主要影响因素是环间垂直距离,优势构型为二面角为45°时的Tilted构型。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2012年04期)

王世军[8](2011)在《应用分子形貌理论和从头算方法研究Be_n(n=2-8)团簇的性质》一文中研究指出本文主要应用杨等人所提出的分子形貌理论,首先对最简单的碱土金属Be_2二聚体进行了系统的研究,得到了Be_2的内禀特征参数,并在Be_2二聚体单重态和叁重态下,探究了其能量、电离能随着核间距变化的动态过程中,内禀特征轮廓上电子密度的变化,并分析了在不同的核间距下Be_2二聚体分子呈现出不同分子形貌的原因。其次应用高斯程序优化得到了Be_n(n=3-8)的稳定构型及其可能存在的异构体,应用分子形貌理论得到了Be_3和Be_4稳定构型及其异构体的分子形貌,得到了相关参数;对于Be_n(n=5-8)主要研究了它们的结构和性质,其中重点研究了Be_6,详细的考虑了自旋多重度等因素对团簇各种异构体的影响,得到了自旋多重度更高的异构体。具体内容如下:1.应用MP2、HF和B3LYP在基组6-311++G(3df,3pd)下,研究了Be_2二聚体在单重态和叁重态时的能量、电离能随核间距变化的关系。使用MELD精密从头计算CISD/6-31+G**和自编的一个电子所受到的作用势(PAEM)程序,绘出在不同核间距下Be_2的分子形貌,直观形象的展示了内禀特征轮廓上电子密度的变化,分析了在不同核间距下Be_2呈现出不同分子形貌的原因。为以后对更大的Be_n团簇的研究打下了基础。2.应用MP2/6-311++G(3df,3pd)优化得到了团簇Be_n(n=3-8)的稳定构型及其可能存在的异构体,并结合自编的程序在Matlab8.0的辅助下绘出了Be_3和Be_4稳定构型和异构体的分子形貌图,得到相关的内禀特征参数。其中,主要考虑了自旋多重度对稳定构型和异构体的影响,得到了很多高自旋态下的异构体,重点研究了Be_6的稳定构型及其异构体的结构和性质,优化得到了14种构型,有八种构型是以前文献没有提到的,其中一些也比较稳定,这八种新的异构体模拟优化得到的相关数据,既丰富了Be_6团簇的异构体理论,又为进一步研究Be团簇提供了可靠的参考价值。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2011-04-01)

姬广富,张艳丽,崔红玲,李晓凤,赵峰[9](2009)在《从头算方法研究面心立方铝在高温高压下的热力学状态方程》一文中研究指出用从头算方法优化计算了面心立方铝的电子结构和总能,得到了它在零温下的状态方程和弹性性质.将得到的总能与晶格体积拟合到Debye模型,获得了非平衡态下的Gibbs自由能与温度、压力之间的关系,在此基础上计算了相应的热状态方程,利用Burakovsky-Preston-Silbar(BPS)熔化模型计算了铝的熔化曲线.所有的电子结构和总能计算都是基于局域密度近似(LDA)和广义梯度近似(GGA)的平均得到的.计算得到的铝在高温、高压下的状态方程与一些热力学性质和熔化曲线同冲击波和静高压实验数据在225GPa压力范围内符合良好.(本文来源于《物理学报》期刊2009年06期)

陈军,徐云,陈栋泉,张景琳[10](2008)在《从头算方法研究Y掺杂的刚玉晶界Σ31》一文中研究指出使用一系列高精度从头计算方法,我们研究了清洁和Y掺杂的α-Al2O3陶瓷晶界Σ31/(0001)的原子结构和能量.为了研究Y的不同替代位置和掺杂浓度,我们建立了一个包含700个原子的周期性超晶格模型.我们的结果显示Y原子更愿意偏聚到由7个Al原子构成的环形结构中心.这一效应可以由Y在这一位置的更有利的成键和更低的晶界形成能得到解释.计算的清洁和Y掺杂晶界形成能分别是3.99和3.67J/m2.计算的电荷平均值显示,晶界区电荷密度低于晶体区.同时,我们也发现晶界引起了静电势在晶界两边的长程不对称分布.(本文来源于《中国科学(G辑:物理学 力学 天文学)》期刊2008年08期)

从头算方法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

通常人体中的化学反应是在水中进行的,氨基酸作为构成蛋白质的基本单位,研究其在水溶液中的各种性质就显得尤为重要。本文对CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽进行研究,先在B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平下对其结构进行优化,再应用ABEEMσπ方法进行局部扫描验证得到相应的局部极小值点,即稳定构象。之后再采用PCM模型对其溶剂化自由能进行计算。选择ABEEMσπ浮动电荷极化力场~([1]),把CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽结构放入水盒子中央进行探究;并在温度298K下,采用NVT系综对CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽结构的水溶液进行动力学模拟,模拟时间1ns。然后使用ABEEMσπ/GB/SA模型计算它们的溶剂化自由能~([2])、非极性和极性部分溶剂化自由能、溶剂可及表面积以及亲水表面积和疏水表面积。计算结果表明,ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场可以准确的计算多肽的溶剂化自由能。可以为蛋白质及其他多肽水溶液的研究提供有利工具。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

从头算方法论文参考文献

[1].庞伟秀,孙运斌.从头算方法研究H_2S分子的非谐振力场和光谱常数[J].阴山学刊(自然科学版).2017

[2].杨巧凤,张超,王倩,赵东霞,杨忠志.应用ABEEMσπ浮动电荷力场和从头算方法研究CH_3COAla-Pro-TyrNHCH_3四肽水溶液中的结构和性质[C].第十叁届全国量子化学会议论文集——第四分会:生命、药物和材料量子化学.2017

[3].庞伟秀,孙运斌.从头算方法研究SO_3分子的光谱常数[J].阴山学刊(自然科学版).2017

[4].宋艳丽,刘亚军.旋轨耦合从头算方法研究CH_2BrI光解离机理[J].高等学校化学学报.2015

[5].陶海征,韩学才,岳远征,赵修建.基于从头算方法玻璃的结构模拟与探测[C].2015年全国玻璃科学技术年会论文专集.2015

[6].王影.从头算方法和ABEEMσπ模型应用于Li~+/Na~+/K~+/Be~(2+)/Mg~(2+)/Ca~(2+)与甲基取代的碱基及水相互作用的研究[D].辽宁师范大学.2015

[7].杨丽君,刘茜,杨胜勇,文丰玉.从头算方法研究五元杂环与苯环相互作用[J].计算机与应用化学.2012

[8].王世军.应用分子形貌理论和从头算方法研究Be_n(n=2-8)团簇的性质[D].辽宁师范大学.2011

[9].姬广富,张艳丽,崔红玲,李晓凤,赵峰.从头算方法研究面心立方铝在高温高压下的热力学状态方程[J].物理学报.2009

[10].陈军,徐云,陈栋泉,张景琳.从头算方法研究Y掺杂的刚玉晶界Σ31[J].中国科学(G辑:物理学力学天文学).2008

论文知识图

自洽求解流程图L‐J 势函数示意图7 从头算方法得到的间隙原子对比...与CCSD(T)方法相比,各种方法的表现...理论计算模型从头算方法中的HF...从头算方法得到的酞菁化合物的...

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