机械损伤日本结缕草转录组中相关转录因子的初步分析

机械损伤日本结缕草转录组中相关转录因子的初步分析

论文摘要

旨为获取机械损伤引起的AP2/EREBP、NAC以及WRKY转录因子相关的差异基因。通过将转录组测序后组装的序列转化为Mapman可识别的探针ID,对这三类转录因子进行筛选分析,加上转录组中Swiss-Prot和Nr数据库的注释。获得AP2/EREBP类转录因子差异基因13个,NAC类差异基因8个,WRKY类差异基因11个,在T8和T9时刻时,AP2/EREBP类、NAC类和WRKY类分别出现一个与对照(T7)相比明显下调的差异基因,而在NAC这一类转录因子中,与对照相比,有2个差异基因先下调,再上调,其余三类转录因子的差异基因均处于上调状态。通过数据库注释表明日本结缕草在遭受机械损伤时AP2/EREBP和WRKY类转录因子能够增强对非生物胁迫和生物胁迫的应答能力,增强抗逆性,并且NAC类转录因子传递信号至茎端分生组织并调控其生长。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  • 2 结果
  •   2.1 AP2/EREBP转录因子相关的DEG信息分析
  •   2.2 NAC转录因子相关的DEG信息分析
  •   2.3 WRKY转录因子DEG信息分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵方东,曾会明

    关键词: 日本结缕草,转录因子,机械损伤

    来源: 生物技术通报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 北京林业大学草坪研究所

    分类号: Q943.2;S688.4

    DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-1052

    页码: 7-12

    总页数: 6

    文件大小: 1883K

    下载量: 155

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