贵州17个世居少数民族及汉族21个Y-SNP遗传多态性研究

贵州17个世居少数民族及汉族21个Y-SNP遗传多态性研究

论文摘要

目的:对贵州苗、布依、土家、侗、彝、仡佬、水、回、白、壮、瑶、毛南、蒙古、仫佬、羌、满、畲等17个世居地少数民族及汉族人群共1171例无直系亲缘关系男性个体的Y染色体NRY(Y chromosome non-recombination region)区21个Y-SNP(Y-chromosomal single nucleotide polymorphism)进行遗传多态性分析,获取上述民族人群Y染色体遗传多态性信息和数据,计算群体间的遗传距离,构建系统进化树,探讨贵州17个世居少数民族及汉族之间与其他民族之间的遗传关系,为民族群体族源研究提供分子生物学的证据。方法:采用SNap Shot法对1171例17个贵州世居少数民族及汉族男性个体21个Y-SNP位点进行复合扩增检测,ABI 3130型遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳分型检测,运用ABI 3130 Genetic Analyzer Data Collection Software v3.0软件收集数据,获取个体21个Y-SNP的分型结果。用直接计数法计算等位基因频率、单倍型频率与单倍群频率,根据公式HD或GD=n(1-ΣPi2)/(n-1)(Pi为单倍型频率或等位基因频率,n为样本数)计算单倍型多样性HD(Haplotype diversity)值及基因多样性GD(Gene diversity)值;用Arlequin3.5软件计算18个群体的遗传距离(Fixation Index,Fst)值,并用MEGA7.0软件根据Fst值用Neighbor-Joining法绘制系统进化树。结果:21个Y-SNP位点中M407在18个民族中突变频率均为0,M175、M214、M9、M89在水族群体的突变频率为1,无多态性(GD=0.0000);M324、M122在18个民族男性样本中均具有多态性,M48位点仅在侗族(GD=0.0298)和彝族(GD=0.0334)中有多态性,47Z位点仅在回族(GD=0.0364)和蒙古族(GD=0.0294)中有多态性,SRY465位点仅在仡佬族(GD=0.0294)与羌族(GD=0.0444)中具有多态性。在18个民族21个Y-SNP检测中,1171例样本共检出75种单倍型,其中唯一单倍型(Unique haplotype,UH)为29种,H1(125次),H2(100次),H9(144次)、H12(230次)为最主要的单倍型。Fst遗传距离矩阵显示:贵州18个民族群体的遗传距离在0.0154-0.6573之间,汉族与仡佬族的遗传距离最小(Fst=0.0154),畲族与毛南族的遗传距离最大(Fst=0.6573);贵州18个民族群体与国内其他民族群体遗传距离比较显示,37个民族之间遗传距离值Fst为0.0008-0.658之间,其中贵州侗族与南方汉族遗传距离最近(Fst=0.0008),贵州畲族与贵州毛南族之间的距离最远(Fst=0.658);与6个亚洲人群遗传距离比较显示:贵州群体与菲律宾人群之间的遗传距离最小(Fst=0.0611)。结论:本研究获得了贵州17个世居少数民族及汉族人群的21个Y-SNP的群体遗传学基础数据;18个民族的遗传距离与语言学分类、历史源流相吻合;壮侗语族的7个民族中均含有百越群体特征单倍群(O1a-M119),印证了壮侗语族与百越民族群体间的关系;苗族、畲族、瑶族、羌族、水族、毛南族、仫佬族人群父系遗传结构单一;贵州满族和蒙古族既与南方民族发生了频繁的基因交流,又保留了某些北方特征。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 缩略词表
  • 引言
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 综述
  •   参考文献
  • 作者简历
  • 致谢
  • 学位论文数据集
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 张秀秀

    导师: 何燕

    关键词: 染色体,单倍型,贵州世居少数民族,汉族,遗传关系

    来源: 贵州医科大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 贵州医科大学

    基金: 国家自然基金(31560306)

    分类号: R394

    总页数: 91

    文件大小: 2626K

    下载量: 119

    相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    贵州17个世居少数民族及汉族21个Y-SNP遗传多态性研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢