谷田土壤微生物多样性及对谷子生理生化和产量的影响

谷田土壤微生物多样性及对谷子生理生化和产量的影响

论文摘要

土壤是农业生态系统中最重要的组成部分,是作物赖以生存的基础物质。土壤肥力是影响作物产量的主要因素,土壤微生物是土壤生物量的重要组成部分。植物根际土壤微生物在改善土壤肥力和促进作物健康生长发面发挥着重要作用。土壤养分、土壤酶活性和土壤微生物多样性是植物根际土壤肥力的重要指示指标。近年来,随着高通量测序技术的应用,植物根际土壤微生物多样性的研究及功能微生物在土壤中发挥的作用逐步得到了证实。土壤中微生物参与土壤氮(nitrogen,N)、磷(phosphorus,P)和钾(potassium,K)的循环,土壤有机碳(soil organic carbon,SOC)的分解和利用及土传病害的抑制。另外,一些土壤微生物作为植物致病菌引起了农作物的病害。谷子(Setaria italica)作为一种重要谷类作物,具耐瘠薄、耐干旱和抗逆性强的特点,常被用作土壤改良的先锋作物种植于我国北方干旱和半干旱地区。本课题主要以谷子根际土壤为研究对象,以谷子产量为衡量指标,对不同的管理模式和土地利用方式下谷子根际土壤养分、微生物量碳(microbial biomass carbon,MBC)和微生物量氮(MBN)进行了测定;对轮作模式下谷子农艺特征、光合指标和抗氧化物酶活性进行了测定;对不同施肥处理、生土和熟土处理及不同轮作模式下所有土壤样品进行了16S rDNA高通量测序;轮作模式下的土壤样品增加了真菌多样性分析;对所有样品的细菌16S rDNA、Pseudomonas spp、nifH、nirS和nirK基因及轮作土壤中真菌ITS区做了荧光定量(real time quantitative PCR,qPCR)检测。主要结果如下:1.不同施肥处理的结果:与PKM、NKM、NPM和NPK相比,N、P、K和有机肥(manure,M)配合施用(NPKM)组,谷子产量最高;土壤有效氮(available nitrogen,AN)、AP、SOC、MBC和MBN的含量及C/N值最高;在门水平,变形杆菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度增加;在属水平,Devosia、Mycobacterium、Opitutus和Chitinophaga的相对丰度增加。冗余分析(redundancy analysis,RDA)显示,AN与Devosia和Mycobacterium的相对丰度呈极显著正相关;SOM与Opitutus和Chitinophaga的相对丰度呈极显著正相关。qPCR结果显示:NPKM组nifH、nirS和nirH基因的丰度显著增加。说明氮和有机肥利于土壤中固氮菌的增殖和细菌多样性的增加,提高了土壤酶活性和谷子产量。2.生土熟化过程的实验结果:与母质生土相比,熟土中,AN、AP、SOC、MBC和MBN的含量及C/N和MBC/MBN值最高,谷子产量也最高;在门水平,变形杆菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度增加;在属水平,Caenimonas、Gemmatimonas、Lysobacter、Ramlibacter、Devosia、Mycobacterium和Streptomyces的相对丰度增加,且与SOC,AN的含量及C/N值呈高度正相关。qPCR结果显示nifH基因丰度显著增加。我们推测Streptomyces、Neorhizobium和Devosia可能参与氮循环。3.不同轮作模式对谷子农艺特征和生理生化的影响:与谷子连作相比,谷子(Setaria italica,Si)-大豆(Glycine max,Gm)-马铃薯(Solanum tuberosum,St)轮作后,谷子产量、株高、穗长和千粒重增加。谷子旗叶丙二醛含量降低;气孔导度、光合速率、蒸腾速率和相对叶绿素含量升高;超氧化物歧化酶和过氧化物酶活性降低;多酚氧化酶活性升高、谷子白发病发病率降低。4.不同轮作模式的结果:与Si相比,Si-Gm-St显著提高了土壤AN、AP、AK、TK、SOC、BMC和BMN的含量及C/N值;土壤碱性磷酸酶和多酚氧化酶的活性升高。细菌16Sr DNA测序结果显示:与连作相比,Si-Gm-St组,在门水平上放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)和蓝细菌(Cyanobacteria)的相对丰度增加;在属水平上增加了Pseudomonas、Lysobacter、Devosia、Acidovorax和Agromyce的相对丰度;RDA显示,这5个属与C/N值及AP、AN和SOC含量呈高度正相关;Pearson分析显示Pseudomonas的相对丰度与谷子发病率呈显著负相关。qPCR显示细菌Pseudomonas spp.和nifH基因的丰度在Si-Gm-St中显著高于轮作。真菌ITS测序结果显示:与谷子连作相比,Si-Gm-St轮作后,在门水平,担子菌门(Basidiomycoda)的相对丰度减少;在属水平,Buergenerula、Rhizophlyctis、Ophioceras、Cyathus、Preussia、Acremonium和Ilyonectria的相对丰度增加。qPCR结果显示,轮作后真菌与细菌的比值减小,真菌多样性增加;细菌丰度和多样性菌增加。

论文目录

  • 中文摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 文献综述
  •   1.1 研究背景
  •   1.2 影响土壤微生物多样性的因素
  •     1.2.1 土壤微生物概述
  •     1.2.2 土壤有机碳和土壤养分
  •     1.2.3 土壤酶活性
  •     1.2.4 植物类型
  •   1.3 不同大田管理模式对微生物多样性的影响
  •     1.3.1 不同耕作模式对土壤细菌多样性的影响
  •     1.3.2 不同耕作模式对土壤真菌多样性的影响
  •   1.4 微生物在农田生态系统碳、氮循环中的作用
  •     1.4.1 微生物在农田生态系统碳循环中的作用
  •     1.4.2 微生物在农田生态系统氮循环中的作用
  •   1.5 土壤微生物的检测方法
  •   1.6 连作对作物农艺指标和生理生化的影响
  •     1.6.1 连作概述
  •     1.6.2 连作对作物农艺性状、光合特性和生理生化指标的影响
  •     1.6.3 连作和轮作对植物病害的影响
  •   1.7 研究内容和意义
  •     1.7.1 研究目的与意义
  •     1.7.2 主要研究内容
  • 第二章 施肥对谷子根际土壤酶活性和细菌多样性的影响
  •   2.1 试验设计与方法
  •     2.1.1 试验场地描述
  •     2.1.2 试验设计
  •     2.1.3 土壤样品采集
  •     2.1.4 谷子产量测定
  •     2.1.5 土壤化学性质测定
  •     2.1.6 土壤酶活性测定
  •     2.1.7 土壤DNA的提取、Illumina MiSeq测序和数据处理
  •     2.1.8 土壤细菌16S rDNA、nifH、nirS和 nirK基因的检测
  •     2.1.9 数据统计分析
  •   2.2 结果与分析
  •     2.2.1 不同施肥处理下谷子产量和根际土壤化学性质
  •     2.2.2 不同施肥处理下谷子根际土壤酶活性
  •     2.2.3 不同施肥处理下谷子根际土壤细菌群落多样性指数
  •     2.2.4 不同施肥处理下谷子根际土壤细菌在门水平上的分类
  •     2.2.5 不同施肥处理对谷子根际土壤细菌在属水平上的分类
  •     2.2.6 不同施肥处理下土壤细菌群落多样性与土壤养分和酶活性的关系
  •     2.2.7 不同施肥处理下谷子根际土壤细菌16S rDNA、nifH、nirS和 nirK基因的检测
  •   2.3 讨论
  •   2.4 结论
  • 第三章 不同土壤对谷子根际土壤酶活性和细菌多样性的影响
  •   3.1 试验设计与方法
  •     3.1.1 试验场地描述
  •     3.1.2 试验设计
  •     3.1.3 土壤样品采集
  •     3.1.4 谷子产量测定
  •     3.1.5 土壤化学性质测定
  •     3.1.6 土壤酶活性测定
  •     3.1.7 土壤DNA的提取,Illumina MiSeq测序和数据处理
  •     3.1.8 土壤细菌16S rDNA、nifH、nirS和 nirK基因的检测
  •     3.1.9 数据统计分析
  •   3.2 结果与分析
  •     3.2.1 不同土壤中谷子产量和根际土壤化学性质
  •     3.2.2 不同土壤中谷子根际土壤中酶活性的变化
  •     3.2.3 不同土壤中谷子根际土壤细菌群落序列数和多样性指数
  •     3.2.4 不同土壤中谷子根际土壤细菌在门水平上分类的变化
  •     3.2.5 不同土壤中谷子根际土壤细菌在属水平上分类的变化
  •     3.2.6 不同土壤中谷子根际土壤细菌群落多样性与土壤养分和酶活性的关系
  •     3.2.7 不同土壤中谷子根际土壤细菌16S rDNA、nifH、nirS和 nirK基因的检测
  •   3.3 讨论
  •   3.4 结论
  • 第四章 不同轮作模式对谷子抽穗期生理生化和产量的影响
  •   4.1 试验设计和方法
  •     4.1.1 试验地描述
  •     4.1.2 试验设计
  •     4.1.3 谷子旗叶光合指标测定
  •     4.1.4 谷子旗叶抗氧化酶活性测定
  •     4.1.5 谷子产量和感病率统计
  •     4.1.6 数据统计分析。
  •   4.2 结果与分析
  •     4.2.1 不同轮作模式谷子对光合指标的影响
  •     4.2.2 不同轮作模式对谷子H2O2和MDA的影响
  •     4.2.3 不同轮作模式对谷子抗氧化酶活性的影响
  •     4.2.4 不同轮作模式对谷子农艺指标和感病率的影响
  •   4.3 讨论
  •   4.4 结论
  • 第五章 不同轮作模式对谷子根际土壤酶活性和微生物多样性的影响
  •   5.1 试验设计与方法
  •     5.1.1 试验地描述
  •     5.1.2 试验设计
  •     5.1.3 土壤样品采集
  •     5.1.4 谷子产量测定
  •     5.1.5 土壤化学性质测定
  •     5.1.6 土壤酶活性测定
  •     5.1.7 DNA提取、Illumina MiSeq测序和数据处理
  •     5.1.8 细菌16S rDNA、nifH、nirS、nirK和Pseudomonas spp.及真菌ITS区的检测
  •     5.1.9 数据统计分析
  •   5.2 结果与分析
  •     5.2.1 不同轮作模式下谷子谷子产量和根际土壤化学性质
  •     5.2.2 不同轮作模式下谷子根际土壤酶活性
  •     5.2.3 不同轮作模式下谷子根际土壤细菌测序数和多样性指数
  •     5.2.4 不同轮作模式下谷子根际土壤在门水平的细菌类群
  •     5.2.5 不同轮作模式下谷子根际土壤在属水平的细菌类群
  •     5.2.6 不同轮作模式下谷子根际土壤真菌测序数和多样性指数
  •     5.2.7 不同轮作模式下谷子根际土壤在门水平的真菌类群
  •     5.2.8 不同轮作模式下谷子根际土壤在属水平上的真菌类群
  •     5.2.9 不同轮作模式下谷子根际土壤微生物类群与土壤酶活性和谷子感病率的关系
  •     5.2.10 不同轮作处理对谷子根际土壤真菌ITS及细菌16S rDNA、nifH、nirS和 nirK基因丰度的影响
  •   5.3 讨论
  •   5.4 结论
  • 结论
  • 展望
  • 附表
  • 参考文献
  • 攻读学位期间取得的研究成果
  • 致谢
  • 个人简况及联系方式
  • 文章来源

    类型: 博士论文

    作者: 徐丽霞

    导师: 仪慧兰

    关键词: 土壤微生物多样性,土壤养分,土壤酶活性,谷子

    来源: 山西大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,农作物

    单位: 山西大学

    分类号: S154.3;S515

    总页数: 122

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