论文摘要
目的探讨通过PIL法和通路富集分析法,预测与宫颈癌相关的潜在mRNA及调控miRNA,证实相关分子调控通路的可靠性和有效性。方法 PIL法是以Borda选举算法为基础,将皮尔逊相关系数（PCC）、因果推理法（IDA）和回归法（Lasso）三者结合,形成的"PIL"综合分析方法。本研究首先分别采用PCC、IDA、Lasso三种方法筛选数据库中宫颈癌相关miRNA及负向调控靶基因。之后,将PIL法预测结果与miRNA数据库中已经试验证实的靶基因及其调控micro RNA（miRNA）的调控信息进行对比验证。最后,通过PIL法筛选出TCGA数据库内与宫颈癌发病最相关即相互作用最显著的1 000个mRNA及调控miRNA,采用KEGG数据库进行信号转导通路富集分析,发现与宫颈癌最具有相关性的靶通路。结果 PIL法共获得10个预测频率>5次的靶基因,包括分泌型卷曲相关蛋白4（SFRP44）,母系表达基因3（MEG3）和NIPA样结构域（NIPA 4）。KEGG数据库从所有信号通路中共鉴定出17个与宫颈癌最具显著相关性的细胞因子-受体作用目标通路(P=8.91×10-7)。结论通过PIL综合分析法进行miRNA数据库资料采集、靶基因筛选、信号通路分析可行、可靠。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 尉文功,陈锐
关键词: 宫颈癌,分析法,信号通路,微小
来源: 哈尔滨医科大学学报 2019年06期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技
专业: 妇产科学,肿瘤学
单位: 复旦大学附属中山医院青浦分院妇科,同济大学附属东方医院妇科
分类号: R737.33
页码: 587-592
总页数: 6
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