导读:本文包含了寡核苷酸芯片论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:核苷酸,芯片,探针,基因芯片,致病菌,原体,技术。
寡核苷酸芯片论文文献综述
王小强,营思思,韩锐郡,袁军[1]（2017）在《多重寡核苷酸连接-聚合酶链式反应-通用基因芯片检测食源性致病菌方法的建立》一文中研究指出目的建立一种基于多重寡核苷酸连接-聚合酶链式反应(MOL-PCR)的食源性致病菌通用基因芯片检测方法。方法针对细菌性食物中毒8种常见致病菌,在各自特异性引物之间设计一对首尾相接的上、下游检测探针。采用多重PCR富集靶序列并作为模板,通过多重连接酶检测反应及通用不对称PCR标记,获得大量含标签互补序列(Anti-tag)的荧光标记单链产物,可与芯片上固定的标签序列(Tag)进行杂交检测。结果该方法能特异性地鉴别单一和多重目标菌感染。纯培养物的检测灵敏度为(1.1~8.5)×10~2CFU/mL。对96份食物中毒和临床腹泻样本检测,芯片结果与常规分离与生化鉴定及荧光定量PCR结果一致。结论该方法为快速、准确、灵敏、高通量地鉴定食源性疾病的病原菌提供了一种新型检测平台。(本文来源于《卫生研究》期刊2017年02期）
王圣洁,林彩丽,严东辉,于少帅,李永[2]（2017）在《寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体》一文中研究指出[目的]不同组植原体检测和鉴别的特异性探针已有报道,为了筛选出适合于我国不同组植原体检测和鉴别的特异性探针,建立管芯片检测和鉴别植原体技术,并对我国发生的疑似植原体病害进行鉴别。[方法]通过PCR扩增结合管芯片杂交技术,对收集到的15种植原体侵染的植物样品及其健康对照进行检测和鉴别。[结果]建立了管芯片检测和鉴别植原体技术体系。15种病害样品中,13种获得显着的阳性杂交信号,并且所有的健康对照都呈现为阴性。13种植原体病害依16Sr DNA直接测序可分为16SrⅠ、Ⅱ、Ⅴ、XIX四组植原体。在所有探针中,植原体的通用探针(Pp-502)可以检测到所有确定的植原体样品。16SrⅠ组特异性探针(PpⅠ-465)可以确定16SrⅠ组的泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩和莴苣黄化4种植原体样品。16Sr II组特异性探针(PpⅡ-629)仅可以确定16Sr II组的花生丛枝、甘薯丛枝和臭矢菜丛枝3种植原体样品。但16Sr V组的枣疯病、樱桃致死黄化和重阳木丛枝及16Sr XIX组的板栗黄化皱缩植原体与其他组专化性探针皆有明显的交叉杂交信号。相比于PCR扩增的凝胶电泳检测,管芯片检测的灵敏度提高了1 000倍。对疑似植原体病害的诊断结果显示河南濮阳的红花槐丛枝的病原应为16Sr V组植原体,福建福州的长春花黄化丛枝应为16SrⅠ组植原体;而北京戒台寺牡丹黄化皱叶和内蒙古包头柳树丛枝未出现任何植原体专化的杂交信号。[结论]管芯片杂交技术作为一种检测和鉴别植原体的方法,可应用于我国植原体病害调查和诊断,并为植原体的鉴别和分类提供可靠的依据。(本文来源于《林业科学研究》期刊2017年01期）
王小强,袁军,韩锐郡,营思思[3]（2017）在《通用多重不对称PCR结合寡核苷酸芯片检测7种食源性致病菌》一文中研究指出应用通用多重不对称聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和寡核酸芯片技术建立一种同时检测7种常见食源性致病菌的方法。每种致病菌上游或下游引物5’端连接一段异源的共有序列。以荧光标记的该共有序列作为通用引物,与限制性特异引物经一步多重不对称PCR同时获得所有目标菌的单链标记靶序列,可被芯片上固定的特异性寡核苷酸探针捕获。通过芯片扫描、分析荧光信号完成检测。标准菌株检测结果证实,该方法可特异地检测单一和混合感染的目标菌,基因组DNA的检测灵敏度为0.1~1 pg。95份模拟污染和零售食品样本芯片检测结果与常规的分离与生化鉴定及荧光定量PCR结果一致。建立的寡核苷酸芯片方法可为快速、特异、灵敏及高通量地鉴定食源性致病菌提供一种有效的检测手段。(本文来源于《食品科学》期刊2017年08期）
吴世军,郑浩然[4]（2015）在《一种面向芯片合成技术的寡核苷酸设计方法》一文中研究指出目的研发适用于芯片合成技术的寡核苷酸设计方法。方法面对芯片合成技术的需求,提出新方法,对需要处理的核苷酸序列,通过交叉匹配及酶切位点消除算法对序列中的交叉匹配片段及酶切位点进行密码子替换,尽可能减少交叉匹配及酶切位点序列的出现,对处理后的序列采用近似Tm值优化方法进行切割。结果比对相同序列在该方法和Tmprime两种方法中的结果,从寡核苷酸长度、Tm值范围、错配片段数等因素进行比较,验证了新方法在处理交叉匹配上有很好的效果。结论该方法符合适用于芯片合成技术的寡核苷酸设计的需求,大大减少了交叉匹配及酶切位点的出现情况,为芯片合成技术的寡核苷酸设计提供了一种有效方法。(本文来源于《北京生物医学工程》期刊2015年05期）
张雪峰[5]（2015）在《应用通用寡核苷酸芯片技术检测病原菌的研究》一文中研究指出本文以DNA为靶标,针对待检细菌制备寡核苷酸芯片,根据杂交条件进行摸索,然后重新确立寡核苷酸芯片,通过结果的相似性来判断样本的种类。检测中利用通用引物SUA和GO7B对涉及40多个进行扩增和标记后,针对不同的种、属的混合模式,增加它们相互之间的分辨能力,同样样品中存在多个菌种时也可检测出来,并为临床诊断提供依据。综合比较,该项检测技术具有良好的使用价值。(本文来源于《中国继续医学教育》期刊2015年06期）
范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉[6]（2014）在《应用基因组杂交、单核苷酸芯片及二代测序技术开展植入前染色体异常诊断》一文中研究指出流产是导致妊娠失败的最常见原因,其中因染色体异常导致的流产占早期自然流产的一半。胚胎染色体异常一部分是由于胚胎发育异常,一部分与遗传相关。我国普通人群中染色体异常的发生率为0.5%~1.0%,而在有不良孕产史的患者中发生率则高达2%~10%[1]。随着辅助生殖技术的发展,体外受精-胚胎移植(IVF-ET)的临床妊娠率有了显着提高,但胚胎着床率却维持在20%左右,其中染色体异常是造成人类胚胎低着床率和早期妊(本文来源于《中国实用妇科与产科杂志》期刊2014年07期）
刘潜,孙云娟,付洁,宋海峰[7]（2014）在《基于核酸杂交-酶联桥接的悬浮芯片技术同时定量反义寡核苷酸药物原型及其代谢物方法的初步建立》一文中研究指出目的利用悬浮芯片技术,建立基于核酸杂交-酶联桥接的悬浮芯片技术对反义寡核苷酸药物原型及其代谢产物同时定量的分析方法。方法本研究在确证探针与微球偶联的基础上,考察生物基质效应、偶联微球浓度、检测探针浓度、S1核酸酶用量以及荧光显色液浓度等因素对方法定量的影响。最终在同一生物样品中对反义寡核苷酸原型及其代谢产物进行同时定量分析。结果通过考察生物基质效应,确定稀释10倍的PBS作为条件优化及样品定量分析的生物学基质;微球浓度为150个/μl,检测探针浓度为400 nmol/L,S1核酸酶用量为1 U/孔,荧光显色液浓度为1μg/ml。在猕猴血浆基质中该方法针对原型与代谢产物序列的定量范围均为7.81~2000 nmol/L。在同时含有低浓度(20 nmol/L)和高浓度(1500 nmol/L)AI-ON1原型(Ai)与AI-ON1缩短代谢产物(Am)的混合血浆样品中,该方法可同时特异性地定量分析Ai与Am。结论本研究成功建立基于核酸杂交-酶联桥接的悬浮芯片定量分析方法,可在微量生物样品中实现对反义寡核苷酸药物原型及其代谢产物的同时定量分析。(本文来源于《国际药学研究杂志》期刊2014年01期）
陈熹,吴灶全,刘正春[8]（2014）在《寡核苷酸芯片探针设计软件研究进展》一文中研究指出基因芯片以其高通量、微型化和自动化等优点成为医学基因诊断的重要工具,芯片探针的设计和筛选是制备高质量基因芯片关键步骤之一。目前,已有不少探针设计软件被开发出来,它们针对不同的设计对象,显示出各自的优势和局限性。本文聚焦寡核苷酸探针筛选设计的叁个基本标准,即特异性、敏感性和熔点(Tm),介绍了探针设计软件研究发展状况。结合文献报道,对软件的用途进行分类说明。本综述将有助于用户快速选择合适的软件用于探针设计,对降低芯片制备成本、提高芯片应用研究效率、促进高性能的探针设计软件研究及商品化具有重要的意义。(本文来源于《生物医学工程学杂志》期刊2014年01期）
张永江,辛言言,朱水芳,李世访[9]（2013）在《苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立》一文中研究指出苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以获得有效的杂交信号,其灵敏度与RT-PCR电泳法相当。该芯片可用于苹果锈果类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。(本文来源于《生物技术通报》期刊2013年02期）
刘潜,孙云娟,付洁,高新,宋海峰[10]（2012）在《基于悬浮芯片技术对反义寡核苷酸定量分析方法的建立》一文中研究指出目的建立基于酶联桥接的悬浮芯片技术对反义寡核苷酸原型以及其代谢物同时进行定量分析。方法分别合成3,端与反义寡核苷酸或其代谢物序列互补的捕获探针,并偶联不同荧光标记地址的微球。通过核酸杂交原理,偶联不同微球的捕获探针分别捕获同一生物样品中反义寡核苷酸以及其代谢物,并通过连接酶的作用,连接上与捕获探针5'端互补并带有生物素标记的检测探针,形成不同微球偶联的完整双链分子。在单链特异性S1核酸酶的作用下,切除不完整的双链结构,最终利用luminex200悬浮芯片分析系统检测不同微球的荧光信号及检测探针报告信号,从而达到对同一样品中的反义寡核苷酸及其代谢物的同时定量分析。结果在17μL血浆基质中该方法的定量范围为:100～0.1 nM。在均含有50 nM或0.5 nM反义寡核苷酸原型及其代谢物的同一样品中,该方法检测反义寡核苷酸原型及其代谢物的交叉反应性小于20%,能够特异性地区分反义寡核苷酸及其代谢物。结论本研究所建立的基于酶联桥接的悬浮芯片技术是一种特异,灵敏和高通量的定量分析方法。能够在同一微量生物样品中同时检测出反义寡核苷酸以及其代谢物,该方法可为寡核酸类药物的药物代谢与动力学研究提供良好的技术基础。(本文来源于《第十届全国药物和化学异物代谢学术会议暨第叁届国际ISSX/CSSX联合学术会议论文集》期刊2012-09-21）
寡核苷酸芯片论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
[目的]不同组植原体检测和鉴别的特异性探针已有报道,为了筛选出适合于我国不同组植原体检测和鉴别的特异性探针,建立管芯片检测和鉴别植原体技术,并对我国发生的疑似植原体病害进行鉴别。[方法]通过PCR扩增结合管芯片杂交技术,对收集到的15种植原体侵染的植物样品及其健康对照进行检测和鉴别。[结果]建立了管芯片检测和鉴别植原体技术体系。15种病害样品中,13种获得显着的阳性杂交信号,并且所有的健康对照都呈现为阴性。13种植原体病害依16Sr DNA直接测序可分为16SrⅠ、Ⅱ、Ⅴ、XIX四组植原体。在所有探针中,植原体的通用探针(Pp-502)可以检测到所有确定的植原体样品。16SrⅠ组特异性探针(PpⅠ-465)可以确定16SrⅠ组的泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩和莴苣黄化4种植原体样品。16Sr II组特异性探针(PpⅡ-629)仅可以确定16Sr II组的花生丛枝、甘薯丛枝和臭矢菜丛枝3种植原体样品。但16Sr V组的枣疯病、樱桃致死黄化和重阳木丛枝及16Sr XIX组的板栗黄化皱缩植原体与其他组专化性探针皆有明显的交叉杂交信号。相比于PCR扩增的凝胶电泳检测,管芯片检测的灵敏度提高了1 000倍。对疑似植原体病害的诊断结果显示河南濮阳的红花槐丛枝的病原应为16Sr V组植原体,福建福州的长春花黄化丛枝应为16SrⅠ组植原体;而北京戒台寺牡丹黄化皱叶和内蒙古包头柳树丛枝未出现任何植原体专化的杂交信号。[结论]管芯片杂交技术作为一种检测和鉴别植原体的方法,可应用于我国植原体病害调查和诊断,并为植原体的鉴别和分类提供可靠的依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
寡核苷酸芯片论文参考文献
[1].王小强,营思思,韩锐郡,袁军.多重寡核苷酸连接-聚合酶链式反应-通用基因芯片检测食源性致病菌方法的建立[J].卫生研究.2017
[2].王圣洁,林彩丽,严东辉,于少帅,李永.寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体[J].林业科学研究.2017
[3].王小强,袁军,韩锐郡,营思思.通用多重不对称PCR结合寡核苷酸芯片检测7种食源性致病菌[J].食品科学.2017
[4].吴世军,郑浩然.一种面向芯片合成技术的寡核苷酸设计方法[J].北京生物医学工程.2015
[5].张雪峰.应用通用寡核苷酸芯片技术检测病原菌的研究[J].中国继续医学教育.2015
[6].范俊梅,李娜,刘忠宇,马慜悦,王辉.应用基因组杂交、单核苷酸芯片及二代测序技术开展植入前染色体异常诊断[J].中国实用妇科与产科杂志.2014
[7].刘潜,孙云娟,付洁,宋海峰.基于核酸杂交-酶联桥接的悬浮芯片技术同时定量反义寡核苷酸药物原型及其代谢物方法的初步建立[J].国际药学研究杂志.2014
[8].陈熹,吴灶全,刘正春.寡核苷酸芯片探针设计软件研究进展[J].生物医学工程学杂志.2014
[9].张永江,辛言言,朱水芳,李世访.苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立[J].生物技术通报.2013
[10].刘潜,孙云娟,付洁,高新,宋海峰.基于悬浮芯片技术对反义寡核苷酸定量分析方法的建立[C].第十届全国药物和化学异物代谢学术会议暨第叁届国际ISSX/CSSX联合学术会议论文集.2012
论文知识图
