节节麦HKT基因的克隆及生物信息学分析

论文摘要

高亲和性钾离子转运蛋白（high affinity K+transporter, HKT）是一类普遍存在于植物体内的离子转运载体,主要负责Na+运输或Na+-K+协同运输,在植物耐盐和维持体内离子稳态的过程中具有重要作用。为了挖掘和预测节节麦（Aegilops tauschii）中HKT基因的序列信息和功能,通过同源克隆技术,从节节麦中获得了HKT基因,命名为AsHKT （GeneBank:MH457099）,并对其基因序列及编码蛋白的结构、理化特性和功能进行了生物信息学分析,结果表明,AsHKT基因的CDS （Coding sequence）序列长度为1 527 bp,最长开放读码框位于1～1 527 bp处,共编码508个氨基酸,分子式为:C2535H4052N662O705S29,蛋白分子量约为56.01 kD,是疏水性蛋白,结构稳定,有明显的跨膜结构域,其二维结构的组成元件有α-螺旋、延伸链和无规则卷曲,分别达到:37.4%,17.13%,45.47%,并且通过同源建模成功预测得到其三维结构。此外,系统进化分析表明,AsHKT基因与小麦7D染色体上的TaHKT2;2基因同源性最高,属于Ⅱ型HKT基因家族,本研究为节节麦和小麦的耐盐分子机理的解析以及节节麦HKT基因的进一步研究提供了参考和理论依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 甘晓龙,刘韬,刘宝龙,陈文杰,张连全,刘登才,张波,张怀刚

关键词: 节节麦,基因,基因克隆,生物信息学分析

来源: 分子植物育种 2019年17期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,自然地理学和测绘学,农业基础科学,农艺学,农作物

单位: 中国科学院西北高原生物研究所,中国科学院大学,中国科学院西北高原生物研究所青海省作物分子育种重点实验室,四川农业大学小麦研究所

基金: 中国科学院科技服务网络计划项目(KFJ-STS-ZDTP-024)资助

分类号: S512.1;S156.4;Q943.2

DOI: 10.13271/j.mpb.017.005644

页码: 5644-5651

总页数: 8

文件大小: 3293K

下载量: 100

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