基于16S测序分析白蜡虫二龄雌雄若虫共生菌的多样性分析

基于16S测序分析白蜡虫二龄雌雄若虫共生菌的多样性分析

论文摘要

[目的]探明白蜡虫二龄雌雄若虫共生菌的种类和结构。[方法]利用高通量测序技术,对白蜡虫二龄雌雄虫16S rRNA的V3-V4区进行高通量测序,使用Uparse软件对有效标签进行聚类,使用Mothur方法与SILVA的SSUrRNA数据库进行物种注释,分析雌雄间共生菌物种丰度及多样性的差异。[结果]共得到了1 798 646条有效标签,以97%相似度为标准进行聚类分析,得到1 334个OTUs,其中,有14个门,29个纲,60个目,109个科,165个属,55个种得到注释。与其他昆虫明显不同,白蜡虫二龄若虫中立克次氏体属为优势菌(雌85.740%,雄95.462%),缺乏布赫纳氏菌和沃尔巴克氏体。[结论]白蜡虫与其它昆虫的共生菌有很大差异,立克次氏体在白蜡虫二龄若虫中占绝对优势,具有固氮作用的根瘤菌目和芽孢杆菌目、能合成类胡萝卜素的鞘脂单胞菌目为次优势菌,在共生菌中占有一定比例。白蜡虫若虫共生菌独特的现象可能与白蜡虫独特的生物习性、生态学特征和营养相关。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 实验虫源
  •   1.2 样品的测序及数据处理
  •     1.2.1 白蜡虫16S rDNA的提取与含量测定
  •     1.2.2 测序信息的分析
  •       1.2.2.1 测序数据处理
  •       1.2.2.2 OTU聚类和物种注释
  •       1.2.2.3 α-多样性分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 序列的拼接组装及OTU分析
  •   2.2 白蜡虫共生菌的多样性分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 吕品,亓倩,杨璞,陈航,陈晓鸣

    关键词: 白蜡虫,二龄若虫,昆虫共生细菌,立克次氏体

    来源: 林业科学研究 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,蚕蜂与野生动物保护

    单位: 中国林业科学研究院资源昆虫研究所国家林业和草原局资源昆虫培育与利用重点实验室

    基金: 中国林业科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金重点项目(CAFYBB2017ZB005),国家林业局948项目(2014-4-66)

    分类号: S899.1

    DOI: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.05.005

    页码: 34-41

    总页数: 8

    文件大小: 1324K

    下载量: 78

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