甘蓝型油菜湿害胁迫响应性状的全基因组关联分析及候选基因预测

论文摘要

湿害严重影响油菜的产量和品质,前人在耐湿机制和生理响应等方面已经做了许多研究,但涉及油菜耐湿相关基因的研究相对较少。本研究以248份甘蓝型油菜品种（系）为材料,进行湿害胁迫处理,调查了8个湿害响应的相关性状,基于60KIlluminaInfiniumSNP芯片基因型数据对各性状耐湿系数进行了全基因组关联分析和湿害响应候选基因预测。结果显示,湿害胁迫较正常灌溉油菜幼苗绿叶数减少,地上部干重和鲜重以及叶片可溶性蛋白含量降低,叶片POD酶活性和MDA含量略有升高。地下部干重和鲜重在多数材料中降低,而在有些材料中升高,变化幅度均较小。经全基因组关联分析共检测到与耐湿系数显著关联的SNP标记36个,可解释表型变异8.28%～12.95%,其中17个所关联的耐湿系数在基因型间具有显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）差异,其所在的Blocks共覆盖了71个候选基因,包括Blast到同源拟南芥基因64个,主要编码转录因子（如Transcription initiation factor IIF、bZIP68、myb-like HTHtranscriptionalregulatorfamilyprotein）、转运蛋白（如SUC2）、生长抑制子（如ING2）、蛋白磷酸酶（如Protein phosphatase2Cfamilyprotein）、 DNA/RNA结合蛋白[如bHLHDNA-bindingsuperfamilyprotein、 RNA-binding（RRM/RBD/RNP motifs） family protein]、激素响应蛋白（如ARF8、ADC2、ERD6、NF-YC9）以及氧化胁迫、渗透胁迫、盐胁迫或水分剥夺响应蛋白（如ERD6、NP1、TIR-NBS-LRR、CRT1b）等。本研究可为揭示甘蓝型油菜耐湿机理和培育耐湿新品种奠定基础。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李阳阳,荆蓉蓉,吕蓉蓉,石鹏程,李欣,王芹,吴丹,周清元,李加纳,唐章林

关键词: 甘蓝型油菜,湿害胁迫响应性状,全基因组关联分析,候选基因

来源: 作物学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 西南大学农学与生物科技学院,西南大学农业科学研究院

基金: 重庆市社会事业与民生保障科技创新主题专项(cstc2016shms-ztzx80010),国家重点研发计划项目(2018YFD0100504),中央高校基本科研业务费专项资金项目(XDJK2019D021)资助~~

分类号: S565.4;Q943.2

页码: 1806-1821

总页数: 16

文件大小: 1676K

下载量: 377

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标签：甘蓝型油菜论文;  湿害胁迫响应性状论文;  全基因组关联分析论文;  候选基因论文;