银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析

论文摘要

以银杏基因组数据为基础,对银杏bHLH转录因子进行筛选和分析,从银杏基因组中鉴定出72条bHLH转录因子。进一步分析发现,不同bHLH转录因子序列长度和分子量差异较大,而理论等电点及亲水性等比较接近;各家族成员均含有N端碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区;该家族可分为17个亚家族,相同亚家族成员保守基序的类型十分相似。通过启动子分析发现,多数银杏bHLH基因启动子均含有光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件等。表达分析结果显示,有7条银杏bHLH基因的表达具有组织特异性,有6条基因在各组织中表达水平都比较高,预测其在银杏生物学过程中具有十分重要的作用。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 冯磊,石元豹,汪贵斌,曹福亮

关键词: 银杏,转录因子,进化分析,表达分析

来源: 江苏农业学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,林业

单位: 南京林业大学南方现代林业协同创新中心,南京林业大学林学院

基金: 林业公益性行业科研专项重大项目(201504105)

分类号: Q943.2;S792.95

页码: 400-411

总页数: 12

文件大小: 2735K

下载量: 526

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标签：银杏论文;  转录因子论文;  进化分析论文;  表达分析论文;