玉米自交系I18人工接种大斑病菌的mRNA表达分析

玉米自交系I18人工接种大斑病菌的mRNA表达分析

论文摘要

本研究对高感玉米自交系I18人工接种大斑病菌,经叶片表型鉴定,叶片病斑呈现增多且扩大的趋势。结果表明,对照与处理检测的表达基因与新基因数目不同,新基因占表达基因比例范围是11.95%~12.87%。自交系I18处理1,处理2、处理3共检测到1 401个共表达基因,上调基因926个,下调基因429个。从韦恩图可以看出,玉米接种大斑病后的基因共表达以上调为主,呈现被诱导激活的趋势,小部分基因表达受到抑制。随着大斑病侵染时间的增加,上调的基因数目呈现先增加后降低的趋势,下调的基因数目呈现升高的趋势,通过使用BLAST软件,对8大数据库进行序列比对,发掘1个下调的新基因,5个上调基因。经GO基因库进行功能注释,本试验检索检测到33 370个基因,分类得到32 048个注释基因,注释率达到96%。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 供试材料
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 材料的处理
  •     1.2.2 菌株培养
  •     1.2.3 m RNA的提取
  •     1.2.4 数据处理与分析
  •       1.2.4. 1 基因表达定量分析:
  •       1.2.4. 2 差异基因分析:
  •       1.2.4. 3 差异表达基因GO分类[9]:
  •       1.2.4. 4 新基因挖掘:
  • 2 结果与分析
  •   2.1 基因表达量分析
  •   2.2 大斑病响应差异表达基因分析
  •   2.3 新基因分析
  •   2.4 差异表达基因GO分类
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 柳兵,张辰,王宇琪,赵仁贵

    关键词: 玉米,大斑病菌

    来源: 东北农业科学 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 植物保护

    单位: 吉林农业大学农学院

    基金: 吉林省农业委员会育种项目(nyz1605)

    分类号: S435.131

    DOI: 10.16423/j.cnki.1003-8701.2019.05.010

    页码: 43-47

    总页数: 5

    文件大小: 1387K

    下载量: 75

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