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烟草NtNHX2基因的克隆及不同逆境下表达模式分析

论文摘要

为了明确NHX （Na+/H+exchanger）家族成员NHX2在烟草中的功能与对非生物逆境胁迫的响应机制,本研究从烟草栽培品种K326中NtNHX2同源克隆NtNHX2基因,利用qRT-PCR分析该基因在不同非生物逆境下的表达模式,综合生物信息学分析,对其功能和调控机制进行初步预测。该基因开放阅读框为1 605 bp,编码534个氨基酸,预测分子量为59.0 kD,理论等电点pI为8.67。同源性分析结果显示,该基因与美花烟草NHX2 （Nicotiana sylvestris NHX2）、野生烟草NHX2 （Nicotiana attenuate NHX2）等具有较高的氨基酸序列同源性,分别为98.70%、98.14%,组织表达分析结果表明,该基因在根、茎、叶、花中均有表达,且在叶中表达量最高。逆境胁迫处理表明,该基因表达在高盐、低钾、4℃条件下受到抑制,在干旱、ABA处理下受到诱导调控,说明NtNHX2参与高盐、低钾、4℃、干旱、ABA非生物逆境胁迫的响应,为NtNHX2的功能研究、探讨其耐盐机制及基因利用提供了理论依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 克隆获得烟草NtNHX2基因
  •   1.2 烟草NtNHX2基因的生物信息学分析
  •     1.2.1 理化性质和疏水性分析
  •     1.2.2 二级、三级结构预测
  •     1.2.3 结构域及亚细胞定位分析
  •     1.2.4 同源性分析
  •   1.3 烟草NtNHX2基因主要在叶中表达
  •   1.4 不同非生物逆境胁迫下烟草NtNHX2基因的表达分析
  •     1.4.1 高盐、低钾处理下的表达分析
  •     1.4.2 干旱、4℃、ABA处理下的表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 材料
  •   3.2 试验材料处理
  •   3.3 烟草NtNHX2基因的克隆
  •   3.4 烟草NtNHX2蛋白生物信息学分析
  •   3.5 烟草NtNHX2基因的表达模式分析
  • 作者贡献

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 罗银,卓维,陈倩,李立芹

    关键词: 烟草,基因,克隆,序列分析

    来源: 分子植物育种 2019年16期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 四川农业大学农学院

    基金: 植物生理学与生物化学国家重点实验室开放课题(SKLPPBKF1505,SKLPPBKF1506)资助

    分类号: S572;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.005224

    页码: 5224-5229

    总页数: 6

    文件大小: 886K

    下载量: 125

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/076ccc03f9ee9698795359a4.html