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巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达

论文摘要

目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CCL18、CXCL8和C3等相关基因与细胞骨架的调控密切相关。结论:Mo向Mφ分化过程中细胞骨架调控相关基因的表达发生了显著改变。

论文目录

  • 1 资料和方法
  •   1.1 资料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 分析芯片数据差异基因
  •     1.2.2 构建蛋白质相互作用网络
  •     1.2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes的核心模块
  • 2 结果
  •   2.1 经RStudio软件获得DEGenes
  •   2.2 构建PPI
  •   2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宋咏刚,胡文慧,余鹏,石玉玲,赵雪,胡祖权,王赟,曾柱

    关键词: 巨噬细胞,单核细胞,细胞骨架,生物信息学,基因芯片

    来源: 贵州医科大学学报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 贵州医科大学基础医学院,贵州医科大学贵州省免疫细胞与抗体工程研究中心生物与医学工程重点实验室,贵州医科大学,贵州医科大学生物与工程学院

    基金: 国家自然科学基金(11762006,31771014,31660258,31860262),贵州省自然科学基金资助项目[黔科合基础(2018)1412],[黔(科合平台人才(2016)5676],[黔科合人才团队(2015)4021],[黔科合平台人才(2017)5718],2011协同创新中心[黔教合协同创新字(2015)04],贵州省细胞与基因工程创新群体[黔教合KY字(2016)031]

    分类号: R392

    DOI: 10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.12.004

    页码: 1383-1389

    总页数: 7

    文件大小: 7650K

    下载量: 113

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/1eb921b2d0fa4b6463d80fb1.html