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ppar-α激动剂的虚拟筛选研究

论文摘要

通过虚拟筛选分子对接技术,利用sc-PDB数据库得到蛋白靶点的5类共晶结构。采用vina程序,基于建立的小分子数据库,分别对5类共晶结构进行对接计算。通过重对接过程,计算rmsd（均方根偏差值）来评估利用vina程序是否适用于该体系,通过构建诱饵化合物以及小分子与蛋白的相互作用分析来验证了模型的可靠程度。最终,利用该模型分别对5个靶点进行虚拟筛选,得到了效果较为理想的7个动剂分子,分析了分子和靶点蛋白的作用模式。

论文目录

  • 1 计算方法
  •   1.1 受体结构的准备
  •   1.2 蛋白结构的选择
  •   1.3 分子对接方法的考察
  •     1.3.1 富集因子的表征
  •     1.3.2 ROC曲线的表征
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 有效活性化合物
  •   2.2 小分子与蛋白的相互作用
  • 3 结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 罗蓓,郭银应,陈双扣,任玉婷

    关键词: 激动剂,分子对接,曲线,虚拟筛选

    来源: 广州化工 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 有机化工

    单位: 重庆科技学院化学化工学院

    基金: 工业发酵微生物重庆市重点实验室开放基金:酪氨酸蛋白激酶抑制剂的定量构效关系及虚拟筛选研究(LIFM201710),重庆科技学院研究生科技创新项目:NASH药物PPAR双重激动剂的虚拟筛选及分子设计(YKJCX1720512)

    分类号: TQ460.1

    页码: 49-51+54

    总页数: 4

    文件大小: 487K

    下载量: 93

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/21d088421205e07a9da5bae5.html