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金茅黑鸡肉品质性状的关联转录组分析

论文摘要

为深入了解家禽肉品质性状形成的分子机制,本实验测定金茅黑鸡胸肌的肉品质,利用RNA-seq技术进行转录组测序,分析转录组基因表达量与肉品质性状间的关联性。结果显示:与金茅黑鸡14周龄肉色显著相关的基因5个,pH57个,剪切力33个,系水力17个;PLEKHS1、MUC等基因为影响肉色的候选基因,LHX9、SPDEF、GRXCR1等基因为系水力的候选基因,NPY、POMC、FGF20、MGAT4C和GUK1基因为影响肌肉pH的候选基因,EDAR基因和HS6ST3基因为肌肉剪切力的主要候选基因;功能分析发现这些基因在调节肌肉纤维、肌间脂肪沉积、脂类代谢、糖代谢过程和磷酸二酯酶水解等方面发挥重要作用,进而影响胸肌肌肉品质的形成。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 胸肌肉品质测定
  •   1.3 转录组测序与数据分析
  •     1.3.1 基因表达量的相关分析
  •     1.3.2 基因表达量和性状（GEM）的关联分析
  •     1.3.3 生物信息学分析
  • 2 结果
  •   2.1 RNA-seq数据产出统计
  •   2.2 基因表达量分析
  •   2.3 遗传进化分析
  •   2.4 基因表达量和性状的关联分析
  •     2.4.1 肉色、系水力候选基因分析
  •     2.4.2 pH候选基因分析
  •     2.4.3 剪切力候选基因分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李国辉,谢恺舟,戴国俊,张跟喜,张涛,杨国明,陈兰,韩威,苏一军,王金玉

    关键词: 金茅黑鸡,转录组,肉品质,候选基因

    来源: 中国畜牧杂志 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 畜牧与动物医学

    单位: 扬州大学动物科学与技术学院教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室,江苏省家禽科学研究所

    基金: 国家现代农业产业技术体系(CARS-41),江苏省现代农业(肉鸡)产业技术体系(SXGC[2017]298),江苏省高校优势学科建设工程专项资金

    分类号: S831.2

    DOI: 10.19556/j.0258-7033.20190301-04

    页码: 85-90

    总页数: 6

    文件大小: 2640K

    下载量: 114

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/4193bd8b705cdaae7583073f.html