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秧鸡科部分鸟类线粒体基因组的比较及系统发育关系分析

论文摘要

秧鸡科鸟类的系统发育关系尚不明确,本研究通过对秧鸡科11属共17种鸟类的线粒体基因组中各基因进行变异位点和简约信息位点分析。选取变异位点和简约信息位点含量均较高的CR、ND2、ND4、ND5及线粒体基因组分别作为分子标记,采用NJ法、ML法和贝叶斯法分别构建系统发育树。通过对各系统树进行比较分析,结果表明:红胸田鸡、小田鸡、紫水鸡、南秧鸡、黑水鸡、白骨顶鸡、新西兰秧鸡、粟腹秧鸡、红眼斑秧鸡、冲绳秧鸡和奥岛秧鸡的系统发育关系明确;考虑将董鸡属划入苦恶鸟属、粟腹秧鸡划入到纹秧鸡属;支持侏秧鸡科独立成科;完整的线粒体基因组是解决秧鸡科鸟类系统发育关系的最优分子标记。研究结果将为后续增加种属,进一步解决秧鸡科鸟类的系统发育关系提供指导。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 变异位点分析
  •   1.2 基于线粒体基因组构建的系统发育树
  •   1.3 基于CR构建的系统发育树
  •   1.4 基于ND2基因构建的系统发育树
  •   1.5 基于ND4基因构建的系统发育树
  •   1.6 基于ND5基因构建的系统发育树
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 数据来源
  •   3.2 数据处理
  •   3.3 构建系统发育树
  • 作者贡献

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 徐小蓉,何诗远,张明明,粟海军,熊勇,王野影

    关键词: 秧鸡科,线粒体基因组,系统发育关系

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室,贵州大学生物多样性与自然保护研究中心

    基金: 国家自然科学基金项目(31400353),贵州省科技计划项目(黔科合基础[2017]1129),贵州师范大学资助博士科研项目(0516008)共同资助

    分类号: Q953

    DOI: 10.13417/j.gab.038.003919

    页码: 3919-3928

    总页数: 10

    文件大小: 3911K

    下载量: 94

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/4907c6b18a5085358ddf9f2e.html