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狗枣猕猴桃胚胎发育晚期富集蛋白的生物信息学分析

论文摘要

胚胎发育晚期富集蛋白(LEA)是目前最受关注的逆境胁迫响应蛋白,在植物受到多种胁迫时LEA蛋白大量表达,从而减轻了植物受到的逆境伤害。利用生物信息学方法对狗枣猕猴桃胚胎发育晚期富集蛋白(AkLEA)进行结构及功能预测。结果表明:狗枣猕猴桃AkLEA的cDNA全长为1 292 bp,CDS为657 bp,编码蛋白由221个氨基酸构成、具有AkLEA的保守序列,是LEA蛋白(PLN03160)超家族的一员,是一个亲水性、稳定的蛋白。与其他17种植物的LEA氨基酸序列进行对比,结果表明,狗枣猕猴桃AkLEA基因与中华猕猴桃变种亲缘关系较近,而与杨树、石榴等植物亲缘关系较远。本研究结果可为狗枣猕猴桃AkLEA基因功能的进一步研究提供参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料来源
  •   1.2 方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 LEA理化性质预测
  •   2.2 AkLEA信号肽和跨膜结构
  •   2.3 狗枣猕猴桃AkLEA功能位点和结构域预测
  •   2.4 AkLEA二级、三级结构预测
  •   2.5 蛋白质修饰位点的预测
  •   2.6 氨基酸序列同源性对比
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘丹,毕德泷,陈鑫,王立凤

    关键词: 狗枣猕猴桃,蛋白,生物信息学

    来源: 江苏农业科学 2019年24期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 园艺

    单位: 牡丹江师范学院

    基金: 牡丹江师范学院科研项目(编号:QN2019005),黑龙江省教育厅项目(编号:1354MSYYB007),黑龙江药用植物开发与利用研究(编号:1353PT007),黑龙江省大学生创新创业训练计划(编号:201910233007)

    分类号: S663.4

    DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.24.007

    页码: 30-33

    总页数: 4

    文件大小: 981K

    下载量: 91

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/4bbff2315f4b5283a32b588b.html