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云南水稻种质资源的遗传多样性及群体结构分析

论文摘要

利用SSR分子标记对覆盖云南16个州(市)的908份水稻种质资源进行遗传多样性及群体结构分析。结果表明,22对SSR标记共检测到193个等位基因,每对标记的等位基因数为4～18,平均8.78;主要等位基因的频率为0.204 8～0.794 1,平均0.380 3;基因多样性指数为0.347 7～0.887 6,平均0.730 7;多态信息含量为0.320 2～0.877 7,平均0.698 6。以地理来源进行分类并分析其遗传多样性,结果表明,云南水稻种质资源在不同州(市)间的遗传差异较大,其中普洱市水稻种质资源的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s遗传多样性及Shannon’s指数最高,而迪庆州和楚雄州相对较低,说明普洱市水稻种质资源的遗传多样性最丰富,而迪庆州和楚雄州相对较低;遗传距离和遗传一致度分析表明,普洱市与西双版纳州水稻种质资源的遗传距离最小、遗传一致度较高,亲缘关系最近,而昆明市与楚雄州水稻种质资源的遗传距离最大、遗传一致度较低,亲缘关系最远。遗传分化分析显示,908份水稻种质资源的遗传变异主要来源于种质内个体间,且种质间的基因流为2.838 8,该值大于1,说明云南水稻种质资源间存在频繁的基因交流现象;NJ聚类分析、PCA主成分分析及Sturcture群体遗传结构分析均将供试材料分为2大类群,其中NJ聚类分析和PCA分析又在2大类群的基础上分为4个亚群,908份云南水稻种质资源并没有按照地理来源进行聚类,交错分布于各个类群中。表明云南水稻种质资源具有极其丰富的遗传多样性,且不同州(市)水稻种质资源的遗传差异较大,将为今后水稻新品种选育提供宝贵的资源材料。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材 料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 水稻叶片的基因组DNA提取
  •     1.2.2 PCR扩增
  •     1.2.3 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 SSR引物的遗传多样性分析
  •   2.2 云南 16 个州（市）水稻种质资源的遗传多样性分析
  •   2.3 云南 16 个州（市）水稻种质资源遗传距离与遗传一致度
  •   2.4 云南水稻种质资源的遗传分化分析
  •   2.5 云南水稻种质资源的聚类分析
  •   2.6 云南水稻种质资源的主坐标分析
  •   2.7 群体结构分析
  • 3 讨 论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈越,陈玲,张敦宇,肖素勤,殷富有,王玲仙,王波,钟巧芳,付坚,程在全

    关键词: 分子标记,云南,水稻种质资源,遗传多样性,群体结构

    来源: 西北农业学报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

    基金: 国家重点研发计划(2017YFD0100202),云南省科技惠民专项(2016RA002)~~

    分类号: S511

    页码: 1778-1789

    总页数: 12

    文件大小: 2062K

    下载量: 400

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/4e3cae752fabced307402104.html