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苏姜猪线粒体基因组全长测序及线粒体基因多样性分析

论文摘要

从分子水平上探究苏姜猪的遗传多样性,采用二代测序方法测定了苏姜猪线粒体基因组全序列,整合NCBI数据库中已公布的家猪类,以及本实验室测定的苏姜猪线粒体基因组全序列,使用蛋白编码基因和rRNA基因联合的数据集,基于贝叶斯法（BI法）和最大似然法（ML法）构建了家猪类的系统发生树,测序结果表明,该样本线粒体基因组全长15 436 bps,包含典型的家猪类线粒体基因组37条基因,结构紧凑,其线粒体基因组碱基组成（A+T）约占40%,（C+G）约占60%,t RNA总共有8处错配,结果表明苏姜猪具有丰富的遗传多样性,江海型线粒体核苷酸多态性高于全国6个类型猪的平均水平,体现了其独特的遗传多样性.在基于线粒体基因组完整编码区的系统发育分析中,苏姜猪在中国6个类型家猪中单独成为一支,支持其作为一个新猪种而存在.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 二代测序流程
  •   1.2 线粒体基因组组装与基因注释
  •   1.3 线粒体基因组注释结果分析
  •   1.4 线粒体基因组遗传多样性分析
  • 2 结果与分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王洁,郭浩君,张晨岭

    关键词: 苏姜猪,线粒体基因组,遗传多样性,系统发育

    来源: 南京师大学报(自然科学版) 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 畜牧与动物医学

    单位: 江苏农牧科技职业学院,江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,南京农业大学动物科技学院

    基金: 国家发改委资助项目(11710015021)

    分类号: S828.8

    页码: 97-102

    总页数: 6

    文件大小: 1154K

    下载量: 173

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/5a89654c6230c985adeb35a9.html