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SHOXa蛋白的生物信息分析及适应性进化研究

论文摘要

目的对SHOX基因进行生物信息学及适应性进化分析,获得氨基酸的基本结构特征和理化性质,研究正选择位点。方法以人SHOXa蛋白序列为模板,应用相关的生物软件进行理化性状、空间结构研究,利用PAML程序检测其SHOXa基因的适应性进化。结果人SHOXa蛋白为292个氨基酸,不具备跨膜结构和信号位点,但有多个磷酸化位点。该蛋白与其他灵长类动物SHOX基因具有较高的同源性,适应性进化分析未发现显著正选择位点,但发现1个潜在的正选择位点(20G)。结论通过对SHOX基因的系统分析,研究其进化特点,为各类矮身材的机制研究提供参考。

论文目录

  • 材料和方法
  •   1 序列数据
  •   2 一级结构和二级结构分析
  •   3 信号位点、亚细胞定位和磷酸化位点分析
  •   4 保守结构域和系统发育分析
  •   5 适应性进化和正选择位点分析
  • 结 果
  •   1 人SHOXa蛋白序列一级结构和理化性质
  •   2 人SHOXa蛋白二级结构
  •   3 信号位点、跨膜结构、亚细胞定位和磷酸化位点分析
  •   4 保守结构域和系统发育分析
  •   5 适应性进化和正选择位点分析
  • 讨 论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 敬存婷,张茜婷,孟仙,李婷婷,任露,李剑兰

    关键词: 基因,适应性进化,矮身材

    来源: 标记免疫分析与临床 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 成都医学院附属妇女儿童医院儿童保健科

    基金: 四川省卫生和计划生育委员会科研课题(编号:15020614)

    分类号: R346;Q811.4

    页码: 1929-1934+1948

    总页数: 7

    文件大小: 4448K

    下载量: 64

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/691c48c161768bd74c58fa09.html