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基于生物信息学分析miRNA-103a-3p在子宫内膜癌中表达及临床意义

论文摘要

目的:基于生物信息学分析方法研究miR-103a-3p在子宫内膜癌（endometrial carcinoma, EC）中的表达情况及其对预后的影响,评估其在EC中的临床意义。方法:本研究利用癌症基因图谱（TCGA）数据库分析miR-103a-3p在EC组织中的表达;利用Kaplan-Meier plotter数据库分析miR-103a-3p与EC患者预后相关性;利用miRWalk 2.0数据库获取miR-103a-3p的靶基因,同时采用DAVID 6.8数据库对靶基因进行GO和KEGG富集分析,进一步以Cytoscape 3.7.1软件构建靶蛋白互作（PPI）网络并筛选核心基因,通过数据库对核心基因进一步验证。结果:TCGA数据库分析显示, miR-103a-3p在EC组织中的表达水平显著高于正常组织。Kaplan-Meier生存分析显示, miR-103a-3p低表达EC患者的总生存时间明显多于高表达患者。GO分析显示,miR-103a-3p的靶基因显著富集到蛋白质结合、细胞质、细胞质基质、细胞膜、核质、ATP结合等生物学过程。KEGG分析显示, miR-103a-3p的靶基因显著富集于AMPK、Hippo等关键信号通路。CDC42、BDNF、FBXW7、CDC27、ACTR2、FASN、CDC23、CD40、FLT3、BAIAP2是miR-103a-3p潜在靶基因PPI网络中的核心基因,经数据库验证在EC中仅CD40的mRNA和蛋白水平显著降低。生存分析显示CD40低表达与EC患者预后不良相关。结论:EC组织中miR-103a-3p低表达在子宫内膜癌相关的生物学过程起重要作用,可能通过调控潜在靶基因CD40参与其中,有潜力成为EC诊断标志物、预后指标及治疗靶点。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 miR-103a-3p在EC中的表达
  •   1.2 生存分析
  •   1.3 miR-103a-3p靶基因预测
  •   1.4 miR-103a-3p靶基因的生物信息学分析
  •   1.5 hsa-miR-103a-3p靶基因PPI网络构建
  •   1.6 miR-103a-3p靶基因PPI网络中的核心基因在EC中的表达分析
  • 2 结果
  •   2.1 人体各肿瘤组织及相应正常组织中miR-103a-3p的表达差异
  •   2.2 miR-103a-3p表达量与EC患者总生存时间的关系
  •   2.3 miR-103a-3p靶基因预测
  •   2.4 miR-103a-3p靶基因GO功能富集分析与KEGG信号通路富集分析
  •   2.5 靶基因PPI网络构建及核心基因
  •   2.6 验证核心基因
  •   2.7 靶基因结合位点生信信息学预测
  • 3 讨论
  • 4 结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周登莲,刘晓岚,邓鑫

    关键词: 子宫内膜癌,靶基因,生物信息学

    来源: 西南医科大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,妇产科学,肿瘤学,生物医学工程

    单位: 西南医科大学教务处,西南医科大学,西南医科大学药物与功能性食品研究中心

    基金: 国家自然科学基金(81800434),四川省卫生健康委员会项目(16ZD033),省级大学生创新创业训练计划(201816032154)

    分类号: R737.33;Q811.4

    页码: 501-506

    总页数: 6

    文件大小: 2231K

    下载量: 202

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/69d195655268338df30b5328.html