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大鼠坐骨神经Wallerian溃变过程中LncRNA的差异表达分析

论文摘要

目的:采用分子生物学和生物信息学方法筛选大鼠坐骨神经损伤后Wallerian溃变(Wallerian degeneration,WD)过程中的关键长链非编码RNA(long none coding RNA, LncRNA),并分析该关键LncRNA分子在大鼠坐骨神经损伤过程中的作用。方法:采用Affymetrix大鼠Non Coding RNA芯片,分析大鼠坐骨神经损伤后WD过程中差异表达的LncRNA;通过实时定量聚合酶链式反应验证关键LncRNA的表达;预测关键LncRNA相关基因及功能。结果:基因芯片分析结果显示共有显著差异性LncRNA 708个和mRNA 2 649个,上调LncRNA 283个,下调LncRNA 425个。通过编码—非编码基因共表达分析和预测竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA)机制,显示在WD过程中发挥作用的LncRNA,其中上调19个,下调17个。WD早期差异表达的LncRNA靶基因11个,WD后期差异表达的LncRNA靶基因31个。结论:大鼠坐骨神经损伤后,LncRNA显著差异性表达,提示LncRNA在周围神经损伤修复与再生过程中可能发挥了一定作用,为进一步分析LncRNA在神经再生中的作用提供了实验基础。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 损伤大鼠坐骨神经Wallerian溃变模型的制备
  •   1.2 SC的培养与纯化
  •   1.3 实时定量聚合酶链式反应（real-time quantitative polymerase chain reation,qPCR）分析
  •   1.4 生物信息学分析
  •   1.5 统计学方法
  • 2 结果
  •   2.1 大鼠坐骨神经损伤远端的表达谱芯片分析差异表达LncRNA
  •   2.2 关键LncRNA筛选与功能预测
  •   2.3 关键LncRNA在神经组织和细胞中的表达
  •   2.4 Lnc RNA CNC分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 蔡敏,李雨婷,高楠楠,邵健,YUNG Bryant,王祎,姚登兵

    关键词: 长链非编码,溃变,周围神经再生,表达谱基因芯片,大鼠

    来源: 南通大学学报(医学版) 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 神经病学

    单位: 南通大学医学院,南通大学神经再生重点实验室,南通大学生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金资助项目(31971277,31950410551),南通市科技计划项目(JC2018091),江苏省研究生科研与实践创新计划项目(KYCX19-2050)

    分类号: R745

    DOI: 10.16424/j.cnki.cn32-1807/r.2019.06.001

    页码: 433-437

    总页数: 5

    文件大小: 1025K

    下载量: 29

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/6d55fb85819b9093bd65f122.html