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犬瘟热病毒HuN-HY171124毒株H基因的克隆与序列分析

论文摘要

为克隆并分析湖南衡阳分离的犬瘟热病毒（CDV）HuN-HY171124毒株H基因,采用逆转录反应合成第一链c DNA,利用巢式PCR扩增H基因全长,将PCR产物纯化克隆至T载体中构建重组载体pMD19-T-CDVHuN-HY171124-H,经序列测定,利用DNAStar和Mega等生物信息学软件进行序列分析。结果显示,CDV HuN-HY171124毒株H基因开放阅读框（OR F）为1824 bp,编码607 aa。相似性比对结果显示,该毒株与GenBank中58株分离毒株的核苷酸相似性在90.4%～98.8%之间,与弱毒疫苗毒株核苷酸的相似性均在90%左右,与我国分离的强毒株核苷酸的相似性均在98%左右。CDV HuN-HY171124毒株H蛋白第519氨基酸氨基酸为精氨酸、第549氨基酸氨基酸为酪氨酸,均为犬源CDV H蛋白特征性氨基酸。遗传进化分析发现该毒株与我国分离的大部分毒株均属于与我国分离的大部分毒株属于Asia 1型,与现有疫苗毒株不处同一个分支。CDV HuN-HY171124毒株是一株犬源CDV,其基因型属于Asia-1型,本研究扩充了CDV区域性流行病学基础数据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 菌株、毒株和质粒
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 CDV第一链c DNA的合成
  •   1.4 引物设计与合成
  •   1.5 巢式PCR扩增H基因
  •   1.6 PCR产物的纯化与克隆
  •   1.7 H基因序列的分析
  • 2结果
  •   2.1 CDV Hu N-HY171124毒株H基因的巢式PCR扩增
  •   2.2重组载体的酶切鉴定
  •   2.3 CDV HuN-HY171124毒株H基因的序列测定与分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 邓莉,张可,唐青海,吴广艳,李轩,吴慧,廖慧,杨海,何丽芳,王芳宇

    关键词: 犬瘟热病毒,巢式,基因,相似性,进化

    来源: 湖南畜牧兽医 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 衡阳师范学院生命科学与环境学院衡阳师范学院畜禽养殖生物工程技术研究所生物资源保护与利用衡阳市重点实验室

    基金: 大学生科技创新项目（[2019]2-1,201710546001）,湖南省教育厅优秀青年项目（17B041）,校企合作项目（ZXXQ201701,18H03）,衡阳师范学院引进人才专项项目（16D20）

    分类号: S852.655

    页码: 31-36

    总页数: 6

    文件大小: 3401K

    下载量: 52

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/6e18e89918288af9d22bec13.html