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基于网络药理学探讨丹参酮ⅡA治疗脊髓损伤的可能机制及相关通路

论文摘要

目的:基于网络药理学分析丹参酮ⅡA治疗脊髓损伤的分子生物学机制及相关通路。方法:利用TCMSP、BATMAN-TCM、DTPS、STITCHI、Swiss Target Prediction 5个数据库筛选出丹参酮ⅡA的作用靶点,利用OMIM、GeneCards、CTD数据库检索脊髓损伤相关基因,利用韦恩图筛选丹参酮ⅡA治疗脊髓损伤的作用靶点。利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络,利用Metascape数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。结果:丹参酮ⅡA共有潜在靶点182个,与脊髓损伤相关的靶点157个,其中肿瘤蛋白p53（TP53）、Myc原癌基因蛋白（MYC）、G1/S-特异性周期蛋白-D1（CCND1）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）、JUN原癌基因蛋白（JUN）5个靶点在蛋白互作网络中具有较为重要的作用。丹参酮ⅡA治疗脊髓损伤涉及的生物学过程主要包括药物反应、脂多糖反应、细胞对DNA损伤刺激的反应等;涉及的分子功能主要包括酶结合、转录因子结合、蛋白结合等。其作用机制可能与cAMP signaling pathway、MAPK signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway、HIF-1 signaling pathway、TNF signaling pathway、Apoptosis等通路有关。结论:丹参酮ⅡA治疗脊髓损伤具有多靶点、多通路作用的特点,其可能通过促进神经元存活、促进轴突再生、抑制神经细胞凋亡、抗炎等过程对脊髓损伤过程进行干预。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 丹参酮IIA靶点的预测
  •   1.2 SCI相关基因靶点的筛选
  •   1.3 丹参酮IIA治疗SCI相关靶点的收集
  •   1.4 蛋白相互作用网络构建与分析
  •   1.5 GO分析与KEGG通路分析
  • 2 结果
  •   2.1 丹参酮IIA基因靶点预测
  •   2.2 SCI相关基因靶点筛选
  •   2.3 丹参酮IIA治疗SCI相关靶点的收集
  •   2.4 丹参酮IIA治疗SCI相关蛋白互作网络的构建与分析
  •   2.5 GO分析
  •   2.6 KEGG通路分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 贺丰,朱立国,赵赫,姚生莲,曹峥,杨永栋,李学朋

    关键词: 丹参酮,脊髓损伤,网络药理学,生物信息学

    来源: 世界中医药 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 中国中医科学院望京医院,清华大学材料学院,北京科技大学,北京中医药大学东直门医院

    基金: 国家自然科学基金项目(81774330),中国博士后科学基金项目(2018M641608)

    分类号: R285

    页码: 2864-2869

    总页数: 6

    文件大小: 1981K

    下载量: 185

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/7166558f9dcc77bf9471ba75.html