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方斑网衣的分子鉴定和系统发育学分析

论文摘要

为鉴定方斑网衣中的隐存种,以新疆地区的方斑网衣为试验材料,用分子系统发育学方法,研究了方斑网衣核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)碱基组成信息、变异位点以及简约信息位点、种内的遗传距离、遗传距离聚类情况、ITS位点系统发育树分析以及基于条形码间隔自动检索鉴定方斑网衣隐存种类。结果表明:方斑网衣ITS基因片段长度为528 bp,其中62个为变异位点、43个为简约位点、460个为保守位点、G+C碱基组成占总含量的56.1%、G+C含量高于A+T含量、单倍型多样性(haplotype (gene) diversity,Hd)为0.993、核酸多样性(nucleotide diversity,Pi)为0.048 76;基于遗传距离构建的聚类树同系统发育树分支聚类情况一致,分为2个大分支;通过条形码自动检索法鉴定出方斑网衣可为2个种。通过综合分析鉴定出方斑网衣2个隐存种即方斑网衣原种(Lecidea tessellata var.tessellata)和方斑网衣蓝变种(Lecidea tessellata var.caesia)。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 试验方法
  •   1.3 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 方斑网衣的形态解剖分析
  •   2.2 DNA提取和PCR扩增
  •   2.3 系统发育树的分析
  •   2.4 遗传距离聚类分析
  •   2.5 方斑网衣ABGD分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 阿尔古丽·加玛哈特,热衣木·马木提

    关键词: 地衣,方斑网衣,系统分类学,系统发育树,新疆

    来源: 北方园艺 2019年14期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 新疆大学生命科学与技术学院

    基金: 国家自然科学基金资助项目(31670023,31760052)

    分类号: Q949.34

    页码: 40-47

    总页数: 8

    文件大小: 2894K

    下载量: 98

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/8215167ed78856f75c443b4c.html