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暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析

论文摘要

为初步探究暗纹东方鲀sox9基因在性腺发育和性别分化过程中的作用,通过设计兼并引物、RACE及荧光定量PCR技术,成功克隆出暗纹东方鲀sox9基因的cDNA全长序列,并分析其相应的生物信息学特征及其在雌雄个体的组织表达水平。结果表明:sox9a基因cDNA全长为1 248 bp(NCBI登录号:MH218818),包括684 bp的ORF,编码227个氨基酸,297 bp的5′UTR和267 bp的3′UTR。sox9b基因全长为1 941 bp(NCBI登录号:MH218819),包括1 470 bp的ORF,编码489个氨基酸,306 bp的5′UTR和165 bp的3′UTR。同源性和系统发育分析结果表明暗纹东方鲀sox9基因与红鳍东方鲀同源性最高,亲缘关系最近。氨基酸多重序列比对结果显示两个Sox9氨基酸序列的HMG box结构域在哺乳动物和鱼类中均高度保守。荧光定量PCR分析显示两个sox9基因普遍存在于雌鱼和雄鱼的各个组织中,且均在雌鱼下丘脑中表达量最高,在精巢中有少量表达,卵巢中几乎不表达。总体来说,除少数组织外,两个sox9基因在雌鱼组织中的表达量普遍高于雄鱼。本研究为了解暗纹东方鲀sox9的遗传特性及相关的生理功能,探索性别分化与性腺发育的分子调控机制提供理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 sox9a和sox9b基因全长序列的克隆
  •   1.3 sox9a和sox9b基因的表达分析
  •   1.4 生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 暗纹东方鲀sox9a和sox9b基因克隆与序列特征
  •   2.2 暗纹东方鲀sox9a和sox9b基因同源性分析及氨基酸序列比对
  •   2.3 暗纹东方鲀Sox9a和Sox9b系统进化树构建
  •   2.4 暗纹东方鲀雌雄个体sox9a和sox9b基因的组织表达分析
  •     2.4.1 sox9a基因在雌雄个体各组织中的表达分析
  •     2.4.2 sox9b基因在雌雄个体组织中的表达分析
  • 3 讨论
  •   3.1 sox9基因的转录形式
  •   3.2 暗纹东方鲀Sox9蛋白功能域分析
  •   3.3 暗纹东方鲀sox9a和sox9b基因的组织表达分析
  • 4 结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 高莹莹,刘新富,胡鹏,刘滨,郭正龙

    关键词: 暗纹东方鲀,基因,克隆,生物信息学,组织表达

    来源: 上海海洋大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 水产和渔业

    单位: 上海海洋大学水产与生命学院,中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,内江师范学院,江苏中洋集团股份有限公司

    基金: 国家重点研发计划(2017YFB0404001)

    分类号: S917.4

    页码: 835-847

    总页数: 13

    文件大小: 13342K

    下载量: 149

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/878db8febf194bef401af1ad.html