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青稞HtLTP1基因的克隆与表达分析

论文摘要

植物nsLTPs广泛存在于植物中,是一种调控植物多个生长发育过程并与角质层形成、脂质转移以及胁迫响应相关的小分子碱性蛋白。本研究利用PCR技术从青稞（肚里黄）中克隆得到一个LTP家族基因,命名为Ht LTP1。该基因的开放阅读框全长为354 bp,编码118个氨基酸。N端具有典型信号肽结构与跨膜区,属于小分子碱性疏水蛋白,具备脂质转运蛋白特性,其空间结构主要由α-螺旋结构和无规则卷曲结构组成。启动子顺式元件分析发现该基因启动子区域含有与抗逆反应和响应激素相关基因的启动子结合位点。同时对该基因的表达模式进行了研究,结果显示HtLTP1在青稞种子中表达最高,其次是茎,根中最低,表现出组织差异性,与大麦表达模式类似。不同胁迫条件下,表达模式不完全相同,冷、盐胁迫后HtLTP1根中相对表达量上调,但在冷胁迫下叶中表达受抑,干旱胁迫后根和叶中的表达量均下降,与大麦胁迫后的表达存在差异。表明青稞HtLTP1在抗冷、耐盐中可能具有与大麦不同的作用。本研究为HtLTP1可能在青稞种子发育及青稞抗逆适应中发挥重要的生物功能提供理论基础。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 青稞HtLTP1基因克隆与序列分析
  •   1.2 青稞HtLTP1基因生物信息学分析
  •     1.2.1 青稞HtLTP1编码氨基酸序列及疏/亲水性分析
  •     1.2.2 青稞HtLTP1蛋白信号肽预测、跨膜区和亚细胞定位分析
  •     1.2.3 青稞HtLTP1蛋白的空间结构预测分析
  •     1.2.4 氨基酸序列同源性比对和进化分析
  •     1.2.5 启动子顺式作用元件分析
  •   1.3 青稞HtLTP1基因的表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 实验材料及样品制备
  •   3.2 不同胁迫处理
  •   3.3 总RNA提取及cDNA模板合成
  •   3.4 引物设计与基因克隆
  •   3.5 HtLTP1生物信息学分析
  •   3.6 HtLTP1基因的表达分析
  • 作者贡献

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 多杰措,李媛,熊辉岩,司建萍,张超,段瑞君

    关键词: 青稞,非特异性脂质转运蛋白,基因克隆,表达分析

    来源: 分子植物育种 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 青海大学生态环境工程学院,青海大学农牧学院,青海省农林科学院青海省青稞遗传育种重点实验室

    基金: 青海省科技厅应用基础研究项目(2016-ZJ-772)资助

    分类号: S512.3;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007286

    页码: 7286-7294

    总页数: 9

    文件大小: 3122K

    下载量: 195

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/8a9c0cdf0843f2232bf8b676.html