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基于16S rDNA高通量测序技术的酱卤熟肉制品细菌多样性研究

论文摘要

目的探讨不同包装类型、不同品种肉类来源酱卤熟肉制品中的菌群组成及丰度。方法提取散装及预包装酱卤熟肉制品中的细菌基因组DNA,应用高通量测序技术对样品中细菌16S rDNA V4变异区域进行测序,分析样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品中的菌群差异。结果不同酱卤熟肉样品菌群结构各不相同且差异较大,其中弧菌属丰度均较高,其次为不动杆菌属、希瓦菌属及嗜冷杆菌属,部分样品尚存在葡萄球菌属、沙门菌属及李斯特菌属等食源性致病菌成分。Alpha多样性结果显示,所有样品菌群丰富度及均匀度均较高,散装样品菌群丰富度明显高于预包装样品;Beta多样性分析发现散装与预包装样品组间菌群差异有统计学意义,散装样品中菌群OTU数明显多于预包装样品。结论高通量深度测序技术可快速精确地掌握熟肉制品中微生物菌群多样性,弧菌菌属可能与酱卤类熟肉制品的变质密切相关,散装类酱卤熟肉制品微生物污染状况比预包装样品普遍要高,存在引发食源性疾病的风险。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 仪器与试剂
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 细菌总DNA提取
  •     1.3.2 PCR扩增及纯化
  •     1.3.3 文库制备及高通量测序
  •     1.3.4 生物信息学分析
  •   1.4 统计学处理
  • 2 结 果
  •   2.1 样本OTU和优势物种分类分析
  •   2.2 聚类分析
  •   2.3 Alpha多样性分析
  •   2.4 Beta多样性分析
  • 3 讨 论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 占利,梅玲玲,张俊彦,陈建才,张云怡,张政

    关键词: 熟肉制品,细菌多样性,高通量测序

    来源: 中国卫生检验杂志 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业,预防医学与卫生学

    单位: 浙江省疾病预防控制中心

    基金: 国家重点研发计划(2017YFC1601503),浙江省分析测试科技计划项目(2018C37017),浙江省医药卫生科技计划项目(2018KY034)

    分类号: R155.5

    页码: 905-909

    总页数: 5

    文件大小: 825K

    下载量: 186

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/8fc077b6b132f06ee58707de.html