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水曲柳FmNAC072基因克隆及表达模式分析

论文摘要

研究水曲柳FmNAC072基因在非生物胁迫及激素信号诱导下的表达特征,为深入分析FmNAC072基因功能提供参考。以水曲柳叶片为材料,用PCR法克隆目的基因,采用生物信息学软件分析其分子结构特征。通过荧光定量PCR研究FmNAC072基因在低温、盐非生物胁迫及ABA、IAA、GA3、JA及SA激素诱导下的表达模式,并分析其时空表达特异性。结果表明,水曲柳NAC072基因序列为FmNAC072。该基因全长1 011bp,含完整的开放阅读框,编码336个氨基酸。生物信息学分析表明FmNAC072为亲水性稳定蛋白,α-螺旋、延伸链和无规则卷曲分布整个蛋白,亚细胞定位预测在细胞核中,与樟子松的蛋白序列具有很高同源性。非生物胁迫处理及激素诱导下,FmNAC072基因表达量与对照组相比差异显著。时空表达检测中,FmNAC072基因在根表达量最高,5月份FmNAC072基因表达量达峰值。FmNAC072基因参与植物生长发育及逆境胁迫的平衡。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 FmNAC072基因克隆
  •     1.2.2 FmNAC072基因编码序列的生物信息学分析
  •     1.2.3 FmNAC072在非生物胁迫、激素诱导下及不同器官和不同发育时期表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 FmNAC072基因编码区全长鉴定
  •   2.2 FmNAC072蛋白一级结构分析
  •     2.2.1 氨基酸序列理化性质分析
  •     2.2.2 亚细胞定位预测和分析
  •     2.2.3 蛋白质亲水/疏水性分析
  •   2.3 FmNAC072蛋白二级结构域预测分析
  •   2.4 FmNAC072蛋白三级结构建模及结合位点预测
  •   2.5 FmNAC072蛋白保守结构域预测
  •   2.6 FmNAC072蛋白系统进化树构建
  •   2.7 FmNAC072低温和盐非生物胁迫下的表达模式
  •   2.8 FmNAC072在不同激素信号下的表达模式
  •   2.9 FmNAC072在不同激素信号下的表达模式
  • 3 讨论与结论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘悦,于磊,赵兴堂,梁楠松,詹亚光

    关键词: 水曲柳,生物信息学分析,基因克隆

    来源: 西部林业科学 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 林业

    单位: 东北林业大学生命科学学院,东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室

    基金: 黑龙江省应用技术研究与开发计划项目(GA19B201)

    分类号: S792.41

    DOI: 10.16473/j.cnki.xblykx1972.2019.06.025

    页码: 161-168

    总页数: 8

    文件大小: 1664K

    下载量: 141

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/982937149b62a667c7efea3a.html