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基于线粒体DNA细胞色素b基因和控制区序列分析西藏雅鲁藏布江黄斑褶鮡种群遗传多样性

论文摘要

采用线粒体DNA（mtDNA）Cyt b基因和D-loop控制区为分子标记,对分布于西藏雅鲁藏布江大峡谷以上里龙段和以下墨脱段2个群体的黄斑褶鮡（Pseudecheneis sulcata）共60个样本进行遗传多样性研究。获得联合基因有效序列长度为1 893 bp,包括Cyt b基因1 060 bp和D-loop控制区833 bp。结果显示,里龙和墨脱2个群体的单倍型多样性值（Hd）均较高（0.701和0.761）,核苷酸多样性值（π）均较低（0.001 00和0.001 09）;高频率的单倍型Hap1和Hap2为2个群体所共享,推测为祖先单倍型;同时,里龙和墨脱群体分别存在5个和6个特有单倍型,且在2个群体中不共享;分子方差分析（AMOVA）显示遗传变异主要来源于种群内部,群体间呈中度遗传分化水平(Fst=0.090 44,P <0.05);中性检验（Tajima’s D、Fu’sFs）和核苷酸不配对(SSD、Hir)分析结果揭示,黄斑褶鮡种群曾经历过种群扩张现象。本研究推测,黄斑褶鮡2个群体间的基因流动存在障碍,雅鲁藏布大峡谷的海拔落差及水文情势等生态屏障可能是阻碍黄斑褶鮡迁徙和交流的主要原因。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集
  •   1.2 PCR扩增与测序
  •   1.3 数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 碱基序列组成
  •   2.2 单倍型分布及遗传多样性
  •   2.3 群体间的遗传距离及分化
  •   2.4 系统进化
  •   2.5 群体历史动态
  • 3 讨论
  •   3.1 黄斑褶的单倍型分布与遗传分化
  •   3.2 黄斑褶的群体历史动态
  •   3.3 黄斑褶资源的遗传保护管理

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 马清芝,马波,李雷,金星,林小婉,金洪宇

    关键词: 黄斑褶鮡,线粒体,细胞色素基因,控制区,遗传多样性,雅鲁藏布江

    来源: 动物学杂志 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 哈尔滨师范大学,中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,上海海洋大学

    基金: 公益性（农业）行业科研专项（No.201403012）,农业农村部财政专项“西藏重点水域渔业资源与环境调查”

    分类号: Q958.8

    DOI: 10.13859/j.cjz.201905011

    页码: 701-710

    总页数: 10

    文件大小: 1037K

    下载量: 186

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/af80ef3c1aa7f60523ca4b7b.html