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2015-2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征

论文摘要

目的分析2015—2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒（NPEV）的分布特征,探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹（AFP）病例监测中柯萨奇病毒B组5型（Cox B5）分离株之间的关系和变迁规律。方法选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点,每月采集监测点的污水进行浓缩富集,取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞（RD）和人喉癌上皮细胞（Hep-2）进行病毒分离。通过反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）获得VP1区序列并进行分析。结果 2015—2018年共采集污水样本84份,共分离242株NPEV,包含19个基因型,Cox B5为比例较高的基因型,占18.18%（44/242）。2015—2018年,环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链,即C3、C4和D3基因亚型。C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型,而D3基因亚型是2016—2018年新出现的传播链。结论 2015—2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO11、Cox B5、Cox B3和ECHO6。Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象。我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统,环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 污水样本采集
  •   1.2 AFP病例和健康儿童的标本采集
  •   1.3 污水标本病毒的浓缩富集
  •   1.4 AFP病例和健康儿童标本的处理
  •   1.5 病毒分离
  •   1.6 病毒核酸提取与反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）
  •   1.7 序列分析与基因分型
  • 2 结果
  •   2.1 环境污水中NPEV的分离情况
  •   2.2 环境污水中NPEV的基因型分布
  •   2.3 Cox B5的同源性分析
  •   2.4 Cox B5的系统进化分析
  • 3 讨论

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李云逸,陆菁,杨玉颖,费洁,张莉萍,李智,胡家瑜,李崇山

    关键词: 非脊髓灰质炎肠道病毒,环境污水,柯萨奇病毒

    来源: 疾病监测 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 预防医学与卫生学,感染性疾病及传染病

    单位: 上海市疾病预防控制中心,上海市嘉定区疾病预防控制中心,上海市闵行区疾病预防控制中心

    基金: 国家科技重大专项(No.2017ZX10103009–003),WHO支持的国际经费项目(No.2017,700629–0)~~

    分类号: R512.5;R181.8

    页码: 1089-1095

    总页数: 7

    文件大小: 4097K

    下载量: 110

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/bc991a3355b063318c1a4dc9.html