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水稻OsRSH基因家族的生物信息学分析

论文摘要

鸟苷(五)四磷酸,即(p)ppGpp (Guanosine tetraphosphate and pentaphosphate),是两类相关核苷酸ppGpp和pppGpp的总称,普遍存在于植物中。环境中光照、盐、PH、UV、植物激素等条件的变化会引起植物中(p)ppGpp水平的改变。植物中(p)ppGpp的合成和水解是由一类叫RSH (RelA/SpoT homolog)的蛋白来完成。有研究发现RSH与植物生长、基因表达及胁迫应答等密切相关,且不同植物中RSH蛋白的种类、结构和表达方式各有不同。本研究利用Interpro、Clustal Omega、splitstree、Plant CARE、Rice xpro等生物工具,分别对水稻RSH家族各成员的蛋白结构进行比较,对它们在光照应答、组织特性表达和激素应答过程中存在的特异性和差异性进行系统的分析,对它们在植物体内的生物功能进行了初步的解析和预测。我们发现水稻Os RSH和拟南芥AtRSH在结构、功能和表达上具有高度相似性,在组织呈现特异性表达,参与激素应答过程,为今后深入开展水稻RSH基因家族的功能研究提供了一定的依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 水稻OsRSH蛋白的种类与结构
  •   1.2 水稻OsRSH启动子分析
  •   1.3 水稻OsRSH表达的时空特性
  •     1.3.1 光周期对水稻Os RSH基因表达的影响
  •     1.3.2 水稻不同组织器官中Os RSH基因的表达情况
  •     1.3.3 Os RSH对激素的应答
  •   1.4 水稻OsRSH和拟南芥AtRSH表达比较
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 核酸分析软件
  •   3.2 蛋白分析软件
  •   3.3 基因表达分析
  • 作者贡献

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 杜丽峨,黄进,王丽,梁欢,金小琬,陈稷

    关键词: 水稻,组织特性表达,激素应答,生物信息学分析

    来源: 分子植物育种 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 四川农业大学农学院,成都理工大学环境学院

    基金: 国家自然科学基金青年科学基金项目(31501242),四川农业大学2018年学科建设双支计划项目共同资助

    分类号: S511

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007277

    页码: 7277-7285

    总页数: 9

    文件大小: 1453K

    下载量: 346

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/bee2121cdac7dbd71556d387.html