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肺癌呼吸标志物筛选及其生物信息学分析

论文摘要

采用结合转录组、代谢通路、蛋白结构的呼出气体检测生物信息学分析方法来确定肺癌气体标志物,用于肺癌的筛选诊断.采用标准仪器(GCMS)检测肺癌病人和正常人的呼吸气体样本;经统计分析,筛选出10种特异性挥发性有机物(VOC).采用转录组分析得到肺癌和健康人的差异表达基因,其富集的代谢通路与人体内产生VOC的代谢通路一致,证明所筛选的VOC标志物与肺癌病人代谢具有相关性.基于此VOC建立的肺癌诊断模型的灵敏度、特异性和整体正确率分别为86.2%,91.2%和89.6%,说明所提方法能简便、有效区分正常人和肺癌病人,为早期肺癌筛查提供方便、可靠的检测方法.

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 呼出气体标本的采集和标准仪器分析
  •   1.2 肺癌特异性VOC筛选
  •   1.3 转录组数据分析
  •   1.4 代谢通路分析
  •   1.5 蛋白结构分析
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 筛选和验证肺癌特异性挥发性有机物
  •   2.2 筛选差异表达基因
  •   2.3 差异表达基因的富集分析
  •   2.4 人体内VOC产生通路
  •     2.4.1 烷烃类
  •     2.4.2 醛酮类
  •   2.5 验证VOC产生通路
  •   2.6 基因突变对VOC的影响
  • 3 结语

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 吴谦,王平

    关键词: 呼出气体检测,肺癌标志物,生物信息学,转录组分析,蛋白结构分析,肺癌早期筛查

    来源: 浙江大学学报(工学版) 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅱ辑,基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,肿瘤学

    单位: 浙江大学生物医学工程教育部重点实验室

    基金: 国家自然科学基金重大仪器专项资助项目（31627801)

    分类号: R734.2;Q811.4

    页码: 2389-2395

    总页数: 7

    文件大小: 1342K

    下载量: 268

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/c0a4d23388d536d437a19f85.html