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大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析

论文摘要

致病性大肠杆菌是引起动物泌尿系统感染的重要病原菌,本研究对泌尿生殖道感染出现潜血的大熊猫尿液中分离的一株致病性大肠杆菌(Escherichia coli CCHTP)进行全基因组测序,检测其中耐药基因和毒力因子的情况,同时对基因岛上耐药和毒力基因及其基因环境进行研究。研究发现,大肠杆菌CCHTP中存在多种类型的耐药基因,其中外排泵系统基因数量最多,包括mdf A、emr E和mdt N等介导多重耐药外排泵的基因。此外,该菌还携带166种毒力因子及563个相关毒力基因,其中属于黏附与侵袭类的毒力因子及相关基因数量最多。对19个基因岛分析发现,基因岛GIs011和GIs017中各有一段包含耐药和毒力基因的序列,两侧与可移动遗传元件(转座酶和插入序列)相连,这些结构可能介导耐药及毒力基因水平转移。本研究通过全基因组测序分析了大熊猫源致病性大肠杆菌中存在的耐药及毒力基因情况,对大熊猫相关疾病的科学治疗、合理用药有重要意义。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 菌株来源
  •   1.2 菌株纯化鉴定
  •   1.3 抗生素药敏试验
  •   1.4 DNA提取
  •   1.5 全基因组测序
  •   1.6 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 药敏实验结果
  •   2.2 大肠杆菌CCHTP全基因组测序结果
  •   2.3 大肠杆菌CCHTP中抗生素耐药基因分析
  •   2.4 大肠杆菌CCHTP中毒力因子分析
  •   2.5 大肠杆菌E.coli CCHTP中耐药和毒力基因环境分析
  • 3 讨论
  • 附录：

    • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 邓雯文,李才武,赵思越,李仁贵,何永果,吴代福,杨盛智,黄炎,张和民,邹立扣

    关键词: 大熊猫,大肠杆菌,全基因组测序,耐药基因,毒力因子

    来源: 遗传 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 中国大熊猫保护研究中心大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室,四川农业大学资源学院

    基金: 中国大熊猫保护研究中心项目(编号：CCRCGP181918),国家自然科学基金项目(编号：31400066)资助~~

    分类号: S852.61

    DOI: 10.16288/j.yczz.19-243

    页码: 1138-1147

    总页数: 10

    文件大小: 1420K

    下载量: 317

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    本文来源: https://www.lunwen66.cn/article/d2a015eff4c6f5d8d0fa5566.html