中山市2014-2016年6株Ⅱ型登革病毒E基因分子特征分析

论文摘要

目的分离鉴定中山市2014-2016年Ⅱ型登革病毒,从分子水平进行分析其地域来源和系统进化情况。方法选取中山市2014-2016年核酸阳性血清6份,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR扩增毒株E基因并进行序列测定,分析其与不同区域流行株和国际标准株的同源性和系统进化情况。结果成功分离培养出2株2014年登革Ⅱ病毒、2株2015年登革Ⅱ病毒、2株2016年登革Ⅱ病毒。ZS2014-02、ZS2014-03与2014年广州分离株D14115在进化关系上最近,2014年的3株病毒氨基酸和核苷酸同源性均达到91. 3%以上;2015年ZS2015-01与广州分离株D14115在进化关系上最近,2015年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为98. 8%和92. 8%;2016年ZS2016-01与2010年巴布新几内亚分离株JN568270. 1进化关系较近,2016年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为91. 4%和88. 8%。结论 6株毒株与国际标准株New Guinea C登革Ⅱ型比较均存在氨基酸位点的差异。2014年2株毒株为广州输入病例,2015年的2株毒株ZS2015-01为广州输入,ZS2015-02为中山市本地二代病例,2016年的ZS2016-01为巴布新几内亚输入,而ZS2016-02为菲律宾输入病例。

论文目录

1 材料与方法

1.1 材料来源

1.2 登革病毒分离

1.3 引物

1.4 RT-PCR扩增病毒E基因并进行序列测定分析

2 结果

2.1 核苷酸及氨基酸序列同源性对比分析

2.2 系统进化树分析

2.4 氨基酸突变位点分析

3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 谢颖,高赛珍,陈子龙,王翠玲,吴衍恒,林金思

关键词: 登革病毒,基因,序列同源性,系统进化

来源: 实用预防医学 2019年03期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,基础医学

单位: 广东省中山市疾病预防控制中心

基金: 中山市科技局医学科研立项课题(20132A73)

分类号: R373.33

页码: 367-370

总页数: 4

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中山市2014-2016年6株Ⅱ型登革病毒E基因分子特征分析

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